登革热病毒分型及患者细胞因子mRNA水平研究
本文关键词:登革热病毒分型及患者细胞因子mRNA水平研究,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:目的利用高分辨率熔解曲线(HRM)分析技术,对四型登革热病毒(DEV)进行快速准确分型鉴定,弥补现有分型方法的不足;利用定量PCR方法,检测登革热患者体内白细胞介素12(IL-12)、白细胞介素10(IL-10)、白细胞介素6(IL-6)、干扰素γ(IFN-γ)、肿瘤坏死因子α(TNF-α) mRNA的表达水平,阐明人体在登革热病毒感染期,体内固有免疫和适应性免疫的情况。方法1.根据NCBI公布的序列,设计HRM分型引物,对不同型别登革热进行分型鉴定,并进行灵敏度和特异性试验,同时采用测序、荧光PCR和普通PCR方法,对HRM分型结果进行验证试验。2.对21例登革热患者和21例健康对照者采集静脉血,用比较CT值法(2-ΔΔCT),检测IL-12、IL-10、IL-6、IFN-γ、TNF-α mRNA的表达水平,分析登革热患者相关细胞因子mRNA变化情况及其与健康对照组之间的差异。结果1.应用HRM分析技术,可对四型登革热病毒进行准确分型,灵敏度高,特异性强,HRM分型结果与测序、荧光PCR和普通PCR分型结果无异。2.登革热患者体内IL-12、IL-10、IFN-γ、TNF-α mRNA的表达水平较健康对照组显著升高,有显著性差异(P0.01,0.05,0.01,0.05);IL-6 mRNA的表达水平较健康对照组有所降低,但无显著性差异(P0.05)。结论1.本研究建立了登革热病毒PCR-HRM分型检测方法,与测序、荧光PCR和普通PCR相比,该方法为登革热分子诊断提供了一种更为快速、准确、廉价的检测方法。2.登革热病毒(DEV)感染可以导致患者体内IL-12、IL-10、IL-6、IFN-γ、 TNF-a五种细胞因子mRNA表达水平的变化,这些细胞因子可能在登革热的发病机制和免疫调节中发挥作用。3. Th1/Th2细胞因子失衡,在登革热患者感染过程和疾病转化中可能发挥重要作用。登革热患者IL-12 mRNA升高可以促进Th1类细胞因子分泌并抑制Th2类细胞因子分泌,发挥Th1免疫应答优势。
【关键词】:登革热病毒 HRM 分型 细胞因子 mRNA
【学位授予单位】:安徽理工大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R512.8;R440
【目录】:
- 摘要5-7
- Abstract7-15
- 注释说明清单15-16
- 引言16-18
- 1 HRM分析技术在登革热病毒分型中的研究和应用18-41
- 1.1 前言18-19
- 1.2 材料与方法19-23
- 1.2.1 细胞株19
- 1.2.2 病毒株19
- 1.2.3 主要仪器19-20
- 1.2.4 主要试剂20-21
- 1.2.5 主要溶液的配制21-22
- 1.2.6 引物设计与合成22-23
- 1.3 实验方法23-29
- 1.3.1 细胞培养23
- 1.3.2 病毒培养23
- 1.3.3 病毒RNA提取23-24
- 1.3.4 RNA质量检测24
- 1.3.5 cDNA合成24-25
- 1.3.6 特异性试验25
- 1.3.7 PCR扩增及HRM分析25-26
- 1.3.8 灵敏度试验26
- 1.3.9 测序验证26-27
- 1.3.10 荧光PCR验证27-28
- 1.3.11 普通PCR验证28-29
- 1.4 实验结果29-37
- 1.4.1 正常C6/36细胞29
- 1.4.2 病毒在C6/36细胞中增殖29-30
- 1.4.3 病毒RNA提取结果30
- 1.4.4 引物特异性30-31
- 1.4.5 PCR-HRM分析结果31-32
- 1.4.6 PCR-HRM灵敏度32-33
- 1.4.7 临床样本检测结果33-34
- 1.4.8 测序结果34-35
- 1.4.9 荧光PCR结果35-36
- 1.4.10 普通PCR结果36-37
- 1.5 讨论37-41
- 2 登革热患者体内细胞因子mRNA表达水平及意义41-56
- 2.1 前言41
- 2.2 材料与方法41-46
- 2.2.1 病例筛选41
- 2.2.2 健康对照41
- 2.2.3 主要仪器41-42
- 2.2.4 主要试剂42-43
- 2.2.5 主要溶液的配制43-44
- 2.2.6 引物设计与合成44
- 2.2.7 比较CT值法(2~(-ΔΔCT))公式推导44-46
- 2.3 实验方法46-49
- 2.3.1 总RNA提取46-47
- 2.3.2 RNA质量检测47
- 2.3.3 cDNA合成47-48
- 2.3.4 标准曲线制备48
- 2.3.5 RT-PCR检测mRNA表达水平48-49
- 2.3.6 统计学分析49
- 2.4 实验结果49-54
- 2.4.1 总RNA提取结果49
- 2.4.2 标准曲线制备结果49-50
- 2.4.3 RT-PCR检测结果50-52
- 2.4.4 数据分析52-54
- 2.5 讨论54-56
- 结论56-57
- 参考文献57-62
- 附录A 双脱氧终止法测序结果62-66
- 后记或致谢66-67
- 作者简介及读研期间主要科研成果67
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