云南省鼠类肠道病毒宏基因组研究

发布时间：2017-03-20 18:02

  本文关键词：云南省鼠类肠道病毒宏基因组研究，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:对与人类密切相关的云南家鼠和野鼠肠道中病毒宏基因组进行系统的研究和分析;阐明鼠类肠道病毒的遗传多样性以及与动物和人类病毒的遗传进化关系。丰富我们对自然环境中未知鼠类病毒的认识,为预防和控制由鼠传播的新发病毒性疾病的暴发和流行提供科学指导。方法:本项目在前期鼠病毒研究的基础上,结合宏基因组学、随机PCR和高通量测序技术,在不知病毒任何遗传背景的情况下,从基因组角度高通量对取自云南省7个地区的212份样本进行宏基因组分析。结果:检测到的鼠类病毒可以归到36个病毒科中。其中RNA病毒包括小核糖核酸病毒科、二顺反子病毒科、无法归类的病毒目、Secoviridae、呼肠孤病毒科、逆转录病毒科、盖病毒科、番茄丛矮病毒科、整体病毒科、环病毒科、Alphatetraviridae、星状病毒科、布尼亚病毒科、Carmotetraviridae、长线形病毒、虹彩病毒科、光滑病毒科、罗达病毒科、微小核糖核酸病毒科;而DNA病毒包括了长尾病毒科、肌病毒科、无法归类的有尾噬菌体目、短尾病毒科、疱疹病毒科、多瘤病毒科、腺病毒科、双DNA病毒科、环病毒科、联体病毒科、丝形病毒科、马赛病毒科、微病毒科、拟态病毒科、分体病毒科、细小病毒科、藻类去氧核糖核酸病毒科和未非分类的病毒。结论:云南省鼠类肠道病毒共检测到36个病毒科;发现了一种新型鼠腺病毒;病毒宏基因组学是分析鼠类肠道病毒的好方法。
【关键词】：云南 鼠类 肠道病毒 宏基因组
【学位授予单位】：大理学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R373.25
【目录】：

• 英文缩略词4-5
• 中文摘要5-6
• Abstract6-7
• 前言7-14
• 1 鼠类与人类关系紧密7
• 2 鼠类是病毒的天然储藏库7-8
• 3 目前我国对鼠源性病毒的研究状况8-9
• 4 宏基因组学的优越性9-11
• 5 鼠类肠道病毒的宏基因组研究进展11-13
• 6 病毒宏基因组学的主要技术路线13
• 7 课题的意义13-14
• 材料与方法14-35
• 1 材料14-21
• 2 方法21-35
• 结果35-50
• 1 12份样品随机PCR的结果35-37
• 2 测序结果及读段（reads）拼接分析37-38
• 3 针对拼接得到的所有重叠群序列，进行了 BLASTx/n 的比对分析38-39
• 4 对病毒相关的重叠群序列，根据具体的病毒科，进一步进行了病毒分类39-41
• 5 各病毒科相关重叠群分析41-50
• 讨论50-53
• 结论53-54
• 参考文献54-59
• 综述59-66
• 参考文献63-66
• 致谢66

【参考文献】

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1 张云智,龚正达,冯锡光,段兴德,吴厚永,翁学,吕元;云南白草岭鼠形小兽群落结构及垂直分布[J];动物学杂志;2002年02期

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本文编号：258181