基质辅助激光解析电离飞行时间质谱分析细菌方法的规范化研究

发布时间：2020-08-09 22:11

【摘要】：目的：基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry，MALDI TOF MS)是最近发展起来的一种分析化学技术，能提供各具特征的细菌质量指纹图谱，实现检测和鉴定的目的。本研究通过对MALDI TOF MS分析细菌的方法进行系统的研究，阐明影响MALDI分析的重要实验因素的作用，并建立MALDI TOF MS分析细菌的标准实验方法，从而实现不同菌种和同一种内不同菌株的鉴定，为建立炭疽芽孢杆菌和鼠疫耶尔森氏菌的质量图谱数据库奠定基础，从而能够快速准确地检测和鉴定我国不同来源的炭疽芽孢杆菌和鼠疫耶尔森氏菌，在生物恐怖或传染性疾病爆发时，作为微生物法医学的一种重要技术，快速、准确地鉴定细菌，并追踪其来源。方法：根据研究目的，选择以下菌株进行试验：革兰氏阳性菌包括含芽孢的炭疽芽胞杆菌和不含芽孢的金黄色葡萄球菌；革兰氏阴性菌包括鼠疫耶尔森氏菌，大肠杆菌和胞外多糖含量高的洋葱伯克霍尔德氏菌；同一属内不同种的细菌(伯克霍尔德氏菌属的7个种)；同一种内的不同菌株(11株大肠杆菌和20株金黄色葡萄球菌)。在试验中，以炭疽芽孢杆菌和鼠疫耶尔森氏菌为目标菌，试验了不同的样品处理方法包括直接分析，溶剂处理(单一溶剂处理和组合溶剂处理)和酶处理(溶菌酶和胰蛋白酶)，及不同的实验因素包括基质、基质溶剂、处理用溶剂、菌体的量、点样方法，通过MALDI TOF MS分析提供的细菌各种成分的质量信息，应用Microbelynx软件进行比较分析，确定标准的实验方法和影响分析结果的重要实验因素。在标准实验方法建立后，对方法的重复性包括同一样品的重复性和批间样品的重复性，及方法的可行性包括安全性和稳定性进行了系统的试验，从而能够应用于分析我国不同来源的炭疽芽胞杆菌和鼠疫耶尔森氏菌。结果：本研究通过MALDI TOF MS分析细菌方法的研究，确定了影响分析结果的重要实验因素，建立了一种用于MALDI TOF MS的标准实验方法，具体的实验一一一一一一遭燮鲤鲤巡壑通竺型暨方案为4 mg的细菌依次采用。，1%TFA和氯仿:甲醇(l:l)处理后，沉淀的菌体重悬于0.1%TFA中，改进的干滴法点样。基质溶液为CHCA溶于乙睛:甲醇:水 (l:l:l)，含有0.1%甲酸和0.01 M 18一冠一6。应用此方法，在m/z 2 000一10 000范围内根据各自的特征图谱可区分不同特性的细菌(不同属内的细菌)包括炭疽芽抱杆菌、金黄色葡萄球菌、鼠疫耶尔森氏菌、大肠杆菌和洋葱伯克霍尔德氏菌;伯克霍尔德氏菌属的不同菌种;大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的不同菌株。同一样品和批间样品的重复性较好;安全性试验中，鼠疫耶尔森氏菌采用建立的标准实验方法处理后即能完全灭活，但未能实现炭疽芽抱杆菌的灭活目的; 稳定性实验中，样品处理后放置7天，能获得与样品处理后立即分析较为一致的结果。结论: 本研究完成了MALDI TOF MS分析细菌方法的标准化，阐明了影响MALDI 分析细菌的重要实验因素，建立了一种 MALDI分析细菌的标准实验方法，分析过程简单、快速、重复性较好。该方法能提供较多的质量信息区分不同特性的细菌(不同属内的细菌)包括含芽抱或不含芽抱的革兰氏阳性菌，及革兰氏阴性菌包括胞外多糖含量高和低的细菌，同一属内的不同菌种和同一种内的不同菌株。安全性试验和稳定性试验显示，采用标准方法处理细菌后，鼠疫耶尔森氏菌即能完全灭活，在7天内分析能得到稳定的实验结果;炭疽芽抱杆菌的灭活还需进一步试验，在7天内分析也能得到稳定的实验结果。基于建立的标准实验方法能够建立强大的质谱数据库系统，通过快速搜索实现细菌的鉴定，在微生物法医学的追踪鉴定中发挥重要作用。
【学位授予单位】：中国人民解放军军事医学科学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2004
【分类号】：R378
【图文】：

界面图,界面,数据文件,样品点

图20.批间RMS值计算的界面。(1，待比较的一批样品的12个样品点;2，待比较的一批样品对应的数据文件名;3，比较的2批样品的24张图谱的RMS值，由于界面的空间有限，不能给出全部的RMS值;4，2批样品对应的数据文件名;5，己建入数据库中的待比较的另一批样品)3.的用性

图谱,数据文件,炭疽,抱杆

图16A的炭疽芽抱杆菌同一样品的12张图谱的RMS值。

图谱,炭疽,抱杆,样品点

示同一样品的12个样品点的图谱的RMS值均小于3，重复性品的重复性试验，19分别是炭疽芽抱杆菌和鼠疫耶尔森氏菌进行3次重复培养谱。表7列出了3批样品的批间RMS值。图20为批间RMS值

【引证文献】