中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1及-DQA1基因多态性的研究

发布时间：2020-10-23 02:11

　　 目的调查中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1等位基因多态性。方法 2017年6月-12月应用PCR-SBT测序分型法对1 000名健康无血缘关系的南方汉族人群外周血样(于2016年8月-2017年5月收集)进行HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因测序分型。HLA-DPA1和-DPB1基因采用自行设计的引物同步扩增检测第2、3外显子,HLA-DQA1检测第1～4外显子。电泳序列导入uTYPE 7.2 HLA分析软件判定基因型。采用直接计数法计算等位基因的分布频率。结果在1 000人份南方汉族无关个体HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1测序分型所获的序列中,无背景信号和杂峰。共检出6种HLA-DPA1等位基因,频率由高到低依次为DPA1~*02∶02 (0.541)DPA1~*01∶03 (0.340)DPA1~*02∶01 (0.095)DPA1~*04∶01 (0.021)DPA1~*02∶07 (0.003)DPA1~*01∶04 (0.002);共检出HLA-DPB1等位基因33种,频率较高的前4种等位基因依次为DPB1~*05∶01(0.401)、DPB1~*02∶01(0.165)、DPB1~*04∶01(0.085)、DPB1~*02∶02(0.071);共检出19种HLA-DQA1等位基因,频率较高的前4种等位基因依次为DQA1~*01∶02(0.196)、DQA1~*03∶02(0.144)、DQA1~*01∶03(0.087)和DQA1~*06∶01(0.085)。结论本文获得了南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因多态性数据,可为人类学、群体遗传学、疾病关联研究等提供重要参考数据。
【文章目录】：
1 对象与方法
    1.1 标本来源
    1.2 主要试剂与仪器
    1.3 PCR引物和测序引物
    1.4 基因组DNA制备
    1.5 SBT测序分型
    1.6 HLA等位基因型的判读
    1.7 统计分析
2 结果
    2.1 PCR产物的特异性扩增
    2.2 HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1测序分型的结果
    2.3 HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1检出的等位基因及其频率
3 讨论

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 鲍自谦;钟艳平;全湛柔;陈浩;邓志辉;;中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1及-DQA1基因多态性的研究[J];中国输血杂志;2019年06期

2 赵德容，孙岚玲;哺乳类MHC多态性的形成[J];国外医学.遗传学分册;1995年06期

3 卢丽君;左维泽;张万江;章乐;吴芳;吴江东;;新等位基因HLA-DRB*116:36的鉴定及确认[J];中国实验血液学杂志;2015年05期

4 俞民澍,邱信芳,薛京伦,刘祖洞,谈家桢,李厚均,刘德祥,李力,余伍忠,唐仙珍,周美蓉;中国汉族、维吾尔族、哈萨克族和回族群体线粒体DNA多态性的研究[J];中国科学(B辑 化学 生物学 农学 医学 地学);1988年01期

5 刘春华;邬丽莎;李莉华;;HLA-DPB1等位基因与四川汉族人哮喘的关联研究[J];泸州医学院学报;2006年04期

6 马骁,李桂琴,黄小杰,王平,王昊,阎小萍;应用PCR-SSP技术检测HLA-B_(27)等位基因[J];中日友好医院学报;2004年01期

7 刘越;郭永晨;米佳;黄耀江;张琳霞;冯金朝;;HLA-DRB1等位基因的多态性及其应用[J];现代生物医学进展;2008年05期

8 方福德;等位基因[J];中华预防医学杂志;2003年02期

9 郎正之;;究竟“何谓等位基因”?[J];生物学通报;1983年03期

10 刘成龙,初荣,吴尊友,Roger Detels;人类白细胞抗原与抗HIV感染之间的遗传关系[J];中国艾滋病性病;2003年06期

相关博士学位论文 前2条

1 张桂清;猕猴Trim5α及MHC II类基因多态性研究[D];华南理工大学;2013年

2 张莹;拟南芥低频核苷酸多态性及基因进化模式的研究[D];南京大学;2011年

相关硕士学位论文 前10条

1 韦丽琼;越南起源食蟹猴MHC-Ⅱ类基因的多态性研究[D];华南理工大学;2011年

2 杜丹丹;川西北猕猴MHC-DRB基因外显子2多态性研究[D];四川农业大学;2011年

3 汪宴廷;猕猴MHC-DPB1基因外显子2多态性研究[D];四川农业大学;2010年

4 郑宇凌;食蟹猴MHC-IB等位基因鉴定及分析[D];华南理工大学;2010年

5 黄国庆;CYP2C9突变等位基因检测及重组原核表达质粒构建[D];广东药学院;2012年

6 胡焕春;两个ZmZF等位基因的分型及表达研究[D];华中农业大学;2008年

7 刘曙光;HLA-A～*110104新等位基因的鉴定及其永生化细胞株的建立和生物学特性研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2006年

8 范积敏;中国南北方人群HLA-DQA1和DQB1基因多态性研究[D];南昌大学;2013年

9 王彤;应用寡核苷酸芯片进行HLA-DQA1基因分型的初步研究[D];中国医科大学;2004年

10 徐翔;使用高通量测序技术测量人脑皮层中精神疾病候选基因mRNA等位基因表达不平衡[D];复旦大学;2011年

本文编号：2852409