中国流行的两个进化分支C4亚型EV71病毒3D蛋白氨基酸变异分析

发布时间：2020-12-11 11:15

　　目的分析不同进化分支肠道病毒71型(EV71)的3D蛋白氨基酸序列的差异,了解潜在毒力相关变异位点。方法从GenBank和实验室收集C4基因亚型EV71全基因序列,以VP1序列做进化分析,统计分析C4a和C4b两进化分支EV71病毒的3D蛋白氨基酸序列。结果共收集病毒序列301株C4型EV71毒株,其中C4a序列293株、C4b序列8株。不同进化分支中3D区有22个氨基酸残基分布有统计学意义。结论两种进化分支C4亚型EV71病毒的3D蛋白,共有22个位点氨基酸变异,其生物学意义有待进一步研究。 

【文章来源】：海峡预防医学杂志. 2019年03期 第1-3页

【文章页数】：3 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料来源
    1.2 病毒基因型/亚型判定
    1.3 病毒氨基酸序列分析
2 结果
    2.1 基于VP1序列的种系进化分析
    2.2 病毒3D蛋白氨基酸序列比较分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]肠道病毒71型非编码区结构与功能研究进展[J]. 董祯,温红玲.  中华实验和临床病毒学杂志. 2018 (05)
[2]昆明市EV71病毒分离株3D蛋白酶序列特征、病毒增殖特性分析[J]. 郑惠文,孙明,范海涛,宁若彤,李嘉祺,李洪哲,杨哲宁,刘龙丁,施海晶.  中国病原生物学杂志. 2017(08)
[3]广西壮族自治区2001年急性弛缓性麻痹病例中2株C4b亚型进化分支人肠道病毒71型VP1编码区基因特征分析[J]. 邓丽丽,刘巍,谢镇国,班华国,谭冬梅,韦一知,马宇燕,卓家同.  中国疫苗和免疫. 2012(06)
[4]EV71毒力相关位点研究进展[J]. 赵钢,施海晶.  国际病毒学杂志. 2012 (06)



本文编号：2910433