利用miRNA发现疾病相关基因

发布时间：2017-04-09 13:14

  本文关键词：利用miRNA发现疾病相关基因，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：随着研究者对疾病和基因之间关系的探讨性研究,两者间的关联逐渐为人们所认知,尤其相关技术的发展更是极大促进了研究的深入,比如基因测序技术。随着高通量测序技术的不断发展,研究者们可以获取更多更直接的编码和非编码物质在人类疾病中表达的数据。由于调控人类发育的编码物质数量巨大,如当前基因样本数高达两万多维,随着维数的增加,获取关键基因的难度也随之增加。近年来关于基因和疾病之间的成果越来越多,研究者们发现众多种疾病间存在很多共性,比如某些基因在多种疾病中都有相似的表达,因此需要通过一定方法鉴别与多种疾病相关的基因,从而探讨基因之间的联系,研究更深层次的疾病网络问题,此背景下PanCancer项目应运而生,用于研究多种疾病间联系的问题。本文针对复杂疾病和基因之间的关系进行了研究,以PanCancer项目给出的数据为对象,基于miRNA和基因之间的靶定关系,提出了一种利用miRNA发现疾病相关基因的方法,避免了直接分析高维基因表达数据的不便。论文取得的创新性成果如下:1.提出了一种利用miRNA发现复杂疾病相关基因的方法,miTOm(miRN A TOmRNA)。miTOm通过分析低维的miRNA数据,再结合miRNA和基因间的靶定关系,进而发现复杂疾病的相关基因,可以避免直接分析高维的mRNA基因表达数据。2.将提出的方法用于PanCancer项目的数据分析。首先利用miTOm分析了PanCancer中的几种单一癌症的样本数据,接着对六种癌症样本合成的组合数据进行了共性分析,结果表明,miTOm方法可以甄别出复杂疾病的相关基因和风险通路。本文提出的miTOm的方法也可以扩展用于其他复杂疾病的分析,为复杂疾病的生物靶向治疗、生物药物研制、致病机理及风险预测提供借鉴。
【关键词】：miRNA PanCancer 致病基因 基因表达 复杂疾病 风险通路
【学位授予单位】：西安电子科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R3416
【目录】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-10
• 符号对照表10-11
• 缩略语对照表11-14
• 第一章 绪论14-18
• 1.1 研究背景14-15
• 1.2 研究内容15
• 1.3 国内外研究现状15-17
• 1.4 研究意义17
• 1.5 文章结构17-18
• 第二章 利用miRNA发现疾病相关基因18-32
• 2.1 PanCancer项目18-19
• 2.2 miRNA概念19-24
• 2.2.1 miRNA命名规则20-21
• 2.2.2 miRNA靶基因技术21-24
• 2.3 Relief算法24-26
• 2.4 miTOm发现疾病相关基因26-30
• 2.5 本章小结30-32
• 第三章 基于miTOm方法的疾病相关基因发现32-42
• 3.1 数据集选定32-33
• 3.2 miTOm发现单个疾病相关基因实验33-38
• 3.2.1 BRC A数据实验33-35
• 3.2.2 KIRC数据实验35-37
• 3.2.3 单个疾病实验结果37-38
• 3.3 miTOm发现多种疾病相关基因实验38-41
• 3.4 本章小结41-42
• 第四章 实验结果分析42-60
• 4.1 单个疾病实验结果分析42-53
• 4.1.1 BRC A实验结果分析42-48
• 4.1.2 KIRC实验结果分析48-53
• 4.2 多种疾病基因实验结果分析53-58
• 4.3 实验结果分析58
• 4.4 本章小结58-60
• 第五章 结论和展望60-62
• 5.1 研究结论60
• 5.2 研究展望60-62
• 参考文献62-66
• 致谢66-68
• 作者简介68-69

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前4条

1 高鹏毅;陈传波;张葵;朱力;胡迎松;李丹;;一种使用多Filter初始化GA种群的混合特征选择模型[J];小型微型计算机系统;2012年11期

2 马圣运;白玉;韩凝;王君晖;翁晓燕;边红武;朱睦元;;miRNA~*生物合成及其功能研究的新发现[J];遗传;2012年04期

3 王兴春;杨致荣;王敏;李玮;李生才;;高通量测序技术及其应用[J];中国生物工程杂志;2012年01期

4 陈岩;来海锋;王清;王卫伟;;基于filter-wrapper的两步特征变量提取方法[J];机电工程;2010年04期

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本文编号：295329