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2013—2018年中国H7N9流感病毒HA与NA进化研究

发布时间:2021-01-26 01:11
  目的研究2013—2018年中国H7N9流感病毒HA与NA进化研究。方法通过收集NCBI网站HA与NA序列数据,对各年份筛选出序列进行进化分析、关键位点分析,糖基化位点分析。结果 H7N9流感病毒HA与NA序列中韩与美国形成两大分支。韩国与中国形成并列分支。2013—2018年间遗传距离增加,同源性递减。所有中国株缺失69~73位缺失"QISNT"。NA糖基化位点42~45位,关键位点193有突变。HA抗原决定簇148位点,182和183位点有变异,关键位点186和134有突变。结论中国H7N9流感病毒HA与NA序列正在变迁,部分关键位点已经发生突变,可能会改变病毒的致病特征。 

【文章来源】:公共卫生与预防医学. 2019,30(03)

【文章页数】:6 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 数据来源
    1.2 方法
        1.2.1 软件
        1.2.2 方法
        1.2.3 系统进化分析
        1.2.4 糖基化位点预测
2 结果
    2.1 同源性分析
    2.2 HA系统进化分析
    2.3 NA系统进化分析
    2.4 HA关键位点分析
    2.5 NA关键位点分析
    2.6 HA抗原决定簇位点分析
    2.7 糖基化位点分析
3 讨论


【参考文献】:
期刊论文
[1]2015—2016年湖北省人感染H7N9禽流感病例流行病学特征与防控实践[J]. 刘红慧,刘力,黄丹钦,刘漫,邢学森.  公共卫生与预防医学. 2017(04)
[2]H7N9禽流感及相关疫情分析评估[J]. 林丹,谢剑锋,严延生.  中国人兽共患病学报. 2017(03)
[3]2013-2014年全国人感染H7N9禽流感疫情媒体信息搜索分析[J]. 刘红慧,吴杨,黄丹钦,陈琦,邢学森.  公共卫生与预防医学. 2015(06)
[4]两株人H7N9禽流感病毒的全基因组测序及分子特征分析[J]. 郭晓兰,司露露,管大伟,王颖,于玉凤,方丹云,武婕,江丽芳.  中山大学学报(医学科学版). 2015(02)
[5]H7N9禽流感病毒对人类致病的分子基础分析[J]. 于玉凤,郭晓兰,王颖,周俊梅,方丹云,曾谷城,晏辉钧,江丽芳.  中山大学学报(医学科学版). 2013(05)
[6]神经氨酸酶茎部氨基酸缺失对H5N1亚型禽流感病毒生物学特性的影响[J]. 王曲直,龙进学,胡顺林,吴艳涛,刘秀梵.  微生物学报. 2006(04)



本文编号:3000216

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