日本血吸虫不同虫株的群体遗传学分析

发布时间：2017-04-29 07:06

  本文关键词：日本血吸虫不同虫株的群体遗传学分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:日本血吸虫病是一种由日本血吸虫感染、寄生的严重危害人体健康的人畜共患寄生虫病,其终宿主多达约46种哺乳动物,在我国仍然是一项不容忽视的公共卫生问题。由于地理隔离等因素的影响,日本血吸虫个体出现了不同程度的遗传变异,从而导致日本血吸虫不同虫株的出现,如地域株、耐药株、实验室传代株等,这使我国进一步控制以致消灭日本血吸虫病面临挑战。日本血吸虫株或种群遗传差异的研究对了解日本血吸虫病传播动态、宿主-寄生虫相互关系、临床症状及诊断、疫苗研制等具有重要意义。因此,本研究将应用微卫星位点对源于安徽一山区血吸虫病流行区的日本血吸虫株进行群体遗传学分析,并与血吸虫实验室传代株及其它地域株进行比较,这将对进一步研究血吸虫病的流行和虫体的进化具有实际意义和理论价值。方法:在本次研究中,应用7个微卫星位点对日本血吸虫现场分离株(安徽石台)和实验室传代株(江苏无锡)共570条尾蚴进行多重PCR扩增,应用13个微卫星位点对4个日本血吸虫地域株(安徽和县、安庆、石台和江苏无锡)共150条成虫进行单重PCR扩增;扩增产物片段长度由上海生物工程(生工)有限公司检测;分别用FSTAT、Pop Gene软件检测每个虫株及位点的遗传多样性和哈迪-温伯格平衡;应用Structure软件构建群体结构;使用Bottleneck软件检测现场分离株和实验室传代株是否经历瓶颈效应;采用Phylip软件构建4个地域株的种系发生树。结果:1、对日本血吸虫(尾蚴)现场分离株和实验室传代株的比较:(1)经GENECAP工具剔除同一只钉螺体内重复的基因型后,共获得现场样本136个基因型,实验室样本86个基因型;(2)现场分离株的群体等位基因数(A)和等位基因丰度(Rs)均高于实验室虫株;(3)瓶颈效应检测表明实验室群体经历了瓶颈效应;(4)群体结构分析结果显示现场群体和实验室群体被清晰地区分开。2、对4个日本血吸虫(成虫)地域株的比较:(1)安徽和县群体的遗传变异程度最低;F-统计量中的Fst值表明群体间遗传分化达到30.7%(25%);成对Rst显示安徽石台群体与安徽安庆群体的亲缘关系最近,与江苏无锡群体的亲缘关系最远;(2)在构建群体结构中,安徽和县群体和江苏无锡群体均被单独聚为一类,安徽安庆群体和安徽石台群体被聚为一类;(3)种系发生树中,江苏无锡群体被单独聚为一类,安徽的和县、石台和安庆群体被聚为一类。结论:1、实验室传代的日本血吸虫尚不能替代自然群体用于血吸虫疫苗研制、药物耐受性等研究;2、不同终宿主来源的日本血吸虫可能存在遗传多态性差异;3、日本血吸虫的群体遗传结构受地理位置、地理环境等影响。
【关键词】：日本血吸虫 微卫星 遗传多态性 群体结构 瓶颈效应 种系发生树
【学位授予单位】：苏州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R383.24
【目录】：

• 摘要4-6
• Abstract6-9
• 引言9-11
• 第一部分 日本血吸虫（尾蚴）现场株与实验室株的遗传学分析11-19
• 材料与方法11-14
• 结果14-18
• 讨论18-19
• 第二部分 日本血吸虫（成虫）不同地域株的群体遗传学分析19-31
• 材料与方法19-24
• 结果24-29
• 讨论29-31
• 结论31-32
• 参考文献32-36
• 综述36-45
• 参考文献42-45
• 攻读学位期间参加学术会议、发表的论文及获得奖励45-46
• 中英文缩略词对照表46-47
• 附录47-49
• 致谢49-50

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 郭凯文,牛安欧;日本血吸虫线粒体DNA的遗传变异[J];热带医学杂志;2004年04期

2 郑苏月;李飞;;分子遗传技术在血吸虫变异方面的研究进展[J];中国血吸虫病防治杂志;2014年01期

中国硕士学位论文全文数据库 前1条

1 夏英定;日本血吸虫：湖北钉螺人工传代及线粒体atp6基因多态性研究[D];中南大学;2011年

  本文关键词：日本血吸虫不同虫株的群体遗传学分析，，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：334380