疾病基因密码子使用特征分析及致病基因预测
发布时间：2021-08-17 09:16
定位候选策略是目前发现疾病基因的主要方法,其关键问题之一是如何对采用连锁分析等方法定位的疾病区间中数以百计的候选基因进行致病风险评估。有效解决这一问题对于缩短疾病基因发现周期、减少花费等都具有重要意义。越来越多的疾病基因被发现,使得采用计算机方法从已知疾病基因中获取知识以帮助发现未知疾病基因成为可能。但是,目前基于表达信息、基因功能以及疾病基因统计特征的三种方法都不能很好地解决这一问题。因为基于表达信息和基因功能的方法的效果严重依赖于表达与功能信息的完整性与准确性,而目前基于疾病基因序列特征的方法仅仅考虑所有疾病基因和正常基因的序列特征在统计水平的差异,没有对不同的疾病区别对待。为了更好地解决这一问题,发现不同疾病的致病基因所特有的序列特征是一种新的途径。密码子使用特征因为其蕴涵的丰富的生物学意义而被选作本研究重点挖掘的特征。一种新的方法被用来提取疾病基因中密码子的使用特征,结果发现导致同一种疾病的致病基因的密码子使用常常表现出疾病特异性,即同种疾病的致病基因之间密码子使用非常相似,而与其他基因则存在显著差别。基于这种疾病特异的密码子使用特征,设计了一种新的预测疾病基因的方法。对46种...
【文章来源】：华中科技大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
家族性肥厚型心肌病（图a）和白内障疾病（图b）的疾病基因中P值小于0.01的密码子使用频率与CUTG中相应密码子平均使用频率的比较
3．在已定位的 52 个心血管疾病区间中（涵盖了 19 种心血管疾病），共有 25 个候选新基因落在心血管疾病定位区间并且可能与该疾病相关，被认为是一个潜在的候选疾病基因。这些分析结果已经提供了 web 服务（http://infosci.hust.edu.cn/），图 4.2是 web 服务界面。
心血管疾病相关新基因数据库结果显示界面
【参考文献】：
期刊论文
[1]Predicting disease genes for familial dilated cardiomyopathy based on the codon usage bias[J]. ZHOU Yanhong1,2, ZHOU Quanxiong1,2, LIU Huailan1,2 & WAN Honghui3 1. Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China; 2. Hubei Bioinformatics and Molecular Imaging Key Laboratory, Wuhan 430074, China; 3. Laboratory of Bioinformatics, Maryland Institute of Dynamic Ge-nomics, Silver Spring, MD 20906, USA. Chinese Science Bulletin. 2005(18)
[2]Identification of true EST alignments and exon regions of gene sequences[J]. ZHOU Yanhong, JING Hui, LI Yanen & LIU Huailan Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Tech- nology, Wuhan 430074, China Correspondence should be addressed to Zhou Yanhong. Chinese Science Bulletin. 2004(23)
[3]多基因遗传病基因研究的策略和方法[J]. 张奎星,朱鼎良,黄薇. 生理科学进展. 2001(03)
[4]致病基因的定位候选克隆[J]. 沈岩. 生命科学. 1999(05)
本文编号：3347499
【文章来源】：华中科技大学湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
家族性肥厚型心肌病（图a）和白内障疾病（图b）的疾病基因中P值小于0.01的密码子使用频率与CUTG中相应密码子平均使用频率的比较
3．在已定位的 52 个心血管疾病区间中（涵盖了 19 种心血管疾病），共有 25 个候选新基因落在心血管疾病定位区间并且可能与该疾病相关，被认为是一个潜在的候选疾病基因。这些分析结果已经提供了 web 服务（http://infosci.hust.edu.cn/），图 4.2是 web 服务界面。
心血管疾病相关新基因数据库结果显示界面
【参考文献】：
期刊论文
[1]Predicting disease genes for familial dilated cardiomyopathy based on the codon usage bias[J]. ZHOU Yanhong1,2, ZHOU Quanxiong1,2, LIU Huailan1,2 & WAN Honghui3 1. Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China; 2. Hubei Bioinformatics and Molecular Imaging Key Laboratory, Wuhan 430074, China; 3. Laboratory of Bioinformatics, Maryland Institute of Dynamic Ge-nomics, Silver Spring, MD 20906, USA. Chinese Science Bulletin. 2005(18)
[2]Identification of true EST alignments and exon regions of gene sequences[J]. ZHOU Yanhong, JING Hui, LI Yanen & LIU Huailan Center for Bioinformatics, Huazhong University of Science and Tech- nology, Wuhan 430074, China Correspondence should be addressed to Zhou Yanhong. Chinese Science Bulletin. 2004(23)
[3]多基因遗传病基因研究的策略和方法[J]. 张奎星,朱鼎良,黄薇. 生理科学进展. 2001(03)
[4]致病基因的定位候选克隆[J]. 沈岩. 生命科学. 1999(05)
本文编号：3347499
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/binglixuelunwen/3347499.html
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