冈田绕眼果蝇丝氨酸蛋白酶抑制蛋白基因的克隆及组织表达水平
发布时间:2021-11-03 15:37
目的筛选并鉴定冈田绕眼果蝇转录组中的丝氨酸蛋白酶抑制蛋白(serine protease inhibitor,serpin)基因,分析其基因结构及在不同发育时期的表达水平。方法利用PCR技术克隆冈田绕眼果蝇serpin基因,对其编码蛋白的氨基酸序列进行生物信息学分析;利用MEGA 7. 0软件对获得的serpin基因进行系统进化树分析;利用HMMTOP version2. 0和TMHMM server version 2. 0软件预测serpin基因的跨膜结构域;利用RT-q PCR检测冈田绕眼果蝇几个不同发育时期(卵、蛆、蛹、雄蝇和雌蝇)中serpin基因表达水平。结果从冈田绕眼果蝇中克隆出serpin基因,开放阅读框全长1 323 bp,编码440个氨基酸,冈田绕眼果蝇serpin基因与其他果蝇serpin基因的氨基酸序列一致性最高为76%,serpin基因序列的系统进化分析表明冈田绕眼果蝇与Drosophila arizonae的进化关系最接近。冈田绕眼果蝇serpin存在跨膜结构,跨膜螺旋区的位置是第21~43位氨基酸。冈田绕眼果蝇serpin基因在卵、蛆、蛹、雄蝇、雌蝇等不同...
【文章来源】:医学动物防制. 2019,35(08)
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 RNA提取与c DNA合成
1.2.2 引物设计
1.2.3 serpin基因克隆与序列分析
1.2.4 系统进化分析
1.2.5 跨膜结构域预测
1.2.6 不同发育阶段表达谱分析
2 结果
2.1 果蝇serpin (Unigene8503) 基因克隆与序列分析
2.2 serpin跨膜结构域预测
2.3 serpin基因组织特异性表达谱
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]埃及伊蚊丝氨酸蛋白酶抑制蛋白基因家族的筛选和表达谱分析[J]. 程金芝,刘鉴,翟慧,吕清巧,颜凤,商正玲,吴家红. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2017(06)
[2]毛首鞭形线虫丝氨酸蛋白酶抑制剂TtSerpin1对蛋白酶的抑制作用[J]. 司徒永立,邵正,邓莉,隋细香,李海舰,许琴英,何庆丰,彭礼飞. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2017(04)
[3]贵州省遵义市冈田绕眼果蝇的诱捕、鉴定及人工饲养[J]. 黄学贵,张露菲,王灵军,郑明辉,刘晖. 医学动物防制. 2017(07)
[4]东方田鼠天然抗体相关的日本血吸虫抗原基因筛选和克隆[J]. 阎玉涛,刘述先,宋光承,徐裕信,何永康. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2001(03)
本文编号:3473940
【文章来源】:医学动物防制. 2019,35(08)
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 RNA提取与c DNA合成
1.2.2 引物设计
1.2.3 serpin基因克隆与序列分析
1.2.4 系统进化分析
1.2.5 跨膜结构域预测
1.2.6 不同发育阶段表达谱分析
2 结果
2.1 果蝇serpin (Unigene8503) 基因克隆与序列分析
2.2 serpin跨膜结构域预测
2.3 serpin基因组织特异性表达谱
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]埃及伊蚊丝氨酸蛋白酶抑制蛋白基因家族的筛选和表达谱分析[J]. 程金芝,刘鉴,翟慧,吕清巧,颜凤,商正玲,吴家红. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2017(06)
[2]毛首鞭形线虫丝氨酸蛋白酶抑制剂TtSerpin1对蛋白酶的抑制作用[J]. 司徒永立,邵正,邓莉,隋细香,李海舰,许琴英,何庆丰,彭礼飞. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2017(04)
[3]贵州省遵义市冈田绕眼果蝇的诱捕、鉴定及人工饲养[J]. 黄学贵,张露菲,王灵军,郑明辉,刘晖. 医学动物防制. 2017(07)
[4]东方田鼠天然抗体相关的日本血吸虫抗原基因筛选和克隆[J]. 阎玉涛,刘述先,宋光承,徐裕信,何永康. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2001(03)
本文编号:3473940
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