乙型肝炎病毒S蛋白的序列特征分析

发布时间：2025-03-18 04:53

　　 乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,与病毒进入细胞有关,它存在逆转录过程并且具有极强的潜伏性。本论文应用生物信息学分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在线分析软件预测乙肝病毒S蛋白的理化性质和亲疏水性、跨膜区域、信号肽特征、磷酸化位点、二级结构以及乙肝病毒S蛋白的最佳抗原表位形成位置等。结果显示了乙肝病毒S蛋白由226个氨基酸组成,理论等电点是8.21,为不稳定蛋白,总平均亲水性为0.649,是疏水蛋白质,并且该蛋白存在信号肽,有4个跨膜区,有30个潜在的磷酸化位点,主要二级结构为α螺旋和无规则卷曲,同时,结合乙型肝炎病毒S蛋白的序列可及性、线性表位、β转角、柔性、抗原性的预测结果,可以找到潜在的抗原表位区域,为乙型肝炎的表位疫苗研制提供重要的参考依据,有利于进一步对乙型肝炎S蛋白的抗原性进行研究。

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【部分图文】：

图1S蛋白中各个氨基酸含量Fig．1ContentofeachaminoacidinSprotein

)、脯氨酸(Pro)、苏氨酸(Thr)含量较高，分别占氨基酸总数的35%、25%、22%、19%。脂肪系数是99．60。理论等电点是8．21，原子总数是3569。带负电荷残基的Asp(天冬氨酸)和Glu(谷氨酸)的数目是27，带正电荷残基的Arg(精氨酸)和Lys(赖氨酸)的总数....

图2S蛋白疏水性预测结果Fig．2HydrophobicitypredictionresultsforSprotein

2．2乙肝病毒S蛋白的亲水性(疏水性)乙肝病毒S蛋白的总平均亲水性为0．649，可能是疏水蛋白质。该蛋白质的组成成分氨基酸的侧链大部分或者全部由碳原子和氢原子组成，不太可能与水分子形成氢键。图2疏水性的测试结果集中反映了不同氨基酸位置的亲疏水性分布情况，阈值线为0，阈值线以上部分....

图3S蛋白二级结构Fig．3SecondarystructureofSprotein

图4S蛋白信号肽预测结果Fig．4SignalpeptidepredictionresultsforSprotein

2．4乙肝病毒S蛋白的信号肽、跨膜区及磷酸化位点分析信号肽的本质是一段氨基酸序列，一般位于多肽链的末端，在蛋白质跨膜转运过程中起作用。如图4所示，S经常被用于预测信号肽的剪切位点［8］，该预测结果中S分值最大为0．606，大于信号肽阈值0．5，S分值与阈值线的交点处的氨基酸位点为....

本文编号：4036033