2013年宜春市甲型H1N1流感病毒分离鉴定及HA基因分子进化分析

发布时间：2017-11-05 19:38

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【摘要】：目的对2013年江西省宜春市甲型H1N1流感病毒HA基因序列及其编码的氨基酸序列进行分子进化分析,为防控甲型H1N1流感大流行和常规监测提供科学根据。方法随机选择11株2013年宜春市疾病预防控制中心流感监测实验室分离到的甲型H1N1流感病毒毒株,提取病毒RNA,One-step RT-PCR扩增HA基因并双向测序。以世界卫生组织疫苗推荐株A/California/07/2009(H1N1)(Gen Bank:CY121680)和几株国内外近几年分离的流感甲型H1N1毒株的HA基因为参考序列,采用DNAStar 7.0和Mega 5.0软件对HA基因及其编码的氨基酸序列进行比对,绘制分子进化树,进行HA变异分析。结果 2013年宜春市11株所测甲型H1N1流感病毒与疫苗推荐株亲缘性较近,进一步参考几株国内外近几年分离到的流感甲型H1N1毒株,HA没有发生较大变异;其HA基因序列二硫键、糖基化位点未发生变异;尽管有7株毒株同时在抗原决定簇区A区和受体结合位点130环或其附近发生单个位点氨基酸替换变异,但未形成流行病学变异新种。结论目前的甲型H1N1流感疫苗仍对人群有保护作用,而抗原决定簇和受体结合位点的变异提示仍需要密切关注甲型H1N1流感的再次流行。
【作者单位】： 宜春市疾病预防控制中心;
【基金】：江西省社会发展类科技计划(No.JXYC2014KSA020)~~
【分类号】：R511.7
【正文快照】： 流感病毒属正粘病毒科、分节段、负链单股RNA病毒,据核衣壳蛋白(NP)和基质蛋白(MP)的差异性可分为甲、乙、丙或A、B、C三型[1]。而甲型流感病毒根据血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的抗原差异性,HA分为16个亚型,NA分为10个亚型[2]。甲型H1N1流感始于2009年3月美国和墨西哥暴发的流

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本文编号：1145598