2012—2014年上海市麻疹病毒学监测情况分析
本文关键词:2012—2014年上海市麻疹病毒学监测情况分析
【摘要】:本研究旨在通过对2012—2014年上海市麻疹病毒监测情况进行分析,研究上海市麻疹病毒流行株核蛋白(nucleoprotein,NP)的基因特征,探索上海市不同传播链麻疹病毒的流行情况。用Vero/Slam细胞对采集的疑似麻疹病例咽拭子标本进行病毒分离,分离到的麻疹毒株用反转录-聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增NP羧基端450个核苷酸,并对扩增产物进行序列测定和基因亲缘性关系分析。2012—2014年上海市疾病预防控制中心共收到2 562份疑似麻疹病例咽拭子标本,分离到710株麻疹病毒流行株,病毒分离阳性率为27.71%。分离到的麻疹病毒流行株中1株为D8基因型,8株为B3基因型,其余均为H1a基因亚型。所有H1a基因亚型分离株与世界卫生组织(World Health Organization,WHO)参考株(GenBank No.AF045212)的核苷酸序列同源性为96.0%~98.0%,氨基酸序列同源性为92.7%~98.0%。D8基因型分离株(SH12-239)与WHO参考株(GenBank No.AF280803)的核苷酸序列同源性为97.8%,氨基酸序列同源性为98.6%。所有B3基因型分离株与WHO参考株(GenBank No.L46753)的核苷酸序列同源性为96.7%~96.9%,氨基酸序列同源性为95.3%。结果提示,2012—2014年上海市麻疹病毒流行株以H1a基因亚型为绝对优势亚型。上海市麻疹监测系统首次监测到D8基因型和B3基因型麻疹病毒在中国内地的存在。
【作者单位】: 上海市疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室 世界卫生组织西太平洋地区麻疹风疹地区参比实验室;
【基金】:“十二五”国家科技重大专项(2012ZX10004-211-003) 上海市公共卫生重点学科建设项目(12GWZX0801)
【分类号】:R511.1;R181.8
【正文快照】: Virological analysis of a surveillance of measles in Shanghai,2012-2014麻疹病毒(measles virus)属于副黏病毒科麻疹病毒属,只有1个血清型。病毒基因组由6个结构基因和2个非结构基因组成,分别编码6个结构蛋白和2个非结构蛋白。世界卫生组织(WorldHealth Organization,WHO
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,本文编号:1239783
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