甘肃省鼠疫菌株差异区段基因分型及其流行病学特征

发布时间：2017-12-22 22:18

  本文关键词：甘肃省鼠疫菌株差异区段基因分型及其流行病学特征　出处：《中国地方病防治杂志》2016年08期 　论文类型：期刊论文

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【摘要】：目的研究甘肃省鼠疫菌差异区段基因分型及其流行特征。方法根据鼠疫菌基因组的23个差异区段(DFR)对202株鼠疫菌进行基因分型,并进行聚类分析。结果 202株鼠疫菌分为8个基因型,即1b型、5型、7型、8型、13型、26型及新发现的GS1型和GS2型。9株黄鼠型菌株被分为13型和26型。18株阿尔金型菌株被分为3个型,其中1株为GS2型,6株为8型,11株为1b型。48株祁连型被分为3个型,其中5株为8型,39株为GS1型,4株为GS2型。127株青藏型菌株被分为6个型,其中1株为5型,6株为7型,56株为8型,39株为1b型,20株为GS1型,5株为GS2型。黄鼠型鼠疫菌的主基因型为26型,阿尔金型鼠疫菌的主基因型为1b型,祁连型鼠疫菌的主基因型为GS1型,青藏型鼠疫菌的主基因型为8型。结论 GS1和GS2为新发现的2个新基因型。黄鼠型鼠疫菌株同阿尔金型、祁连型和青藏型菌株基因型相似度较小,阿尔金型、祁连型和青藏型基因型相似度较大。
【作者单位】： 甘肃省疾病预防控制中心;
【基金】：国家卫生行业科研专项(201202012) 甘肃省卫生行业计划项目(gswst09-14) 甘肃省卫生行业管理项目(GWGL2010-33)
【分类号】：R516.8;R181.3
【正文快照】： 差异区段(DFR)是指在某些菌株基因组中存在,而在另外一些菌株的基因组中缺失的基因簇,DFR的缺失和获得反应了鼠疫菌在自然界适应性演化的遗传基础[1,2]。甘肃省有青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地,自20世纪60年代至今,从这些疫源地

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本文编号：1321272