北京地区37例流感患者的病毒遗传变异及耐药突变分析
本文关键词： 流感病毒 人 金刚烷胺 神经氨酸酶抑制剂 抗药性 突变 出处：《解放军医学杂志》2016年02期 论文类型：期刊论文
【摘要】：目的分析2013-2014年度北京地区A型H1N1、H3N2和B型流感病毒神经氨酸酶(NA)基因的遗传变异情况,以及流感病毒对金刚烷胺类和NA抑制剂类(NAIs)抗病毒药物的耐药变异情况。方法从37例流感病毒感染患者的鼻/咽拭子样本中提取RNA,采用荧光定量PCR检测流感病毒的基因型/亚型;反转录PCR方法扩增A型流感病毒的NA和基质蛋白M2(M2)基因片段及B型流感病毒的NA和血凝素(HA)基因片段,直接DNA测序。采用Mega软件构建系统进化树分析病毒的演变情况,Vector NTI软件分析耐药变异情况。结果 37例患者中共检出A型流感病毒29例,其中H1N1 23例,H3N2 6例;B型流感病毒8例。所有A型流感病毒均发生M2基因S31N金刚烷胺类药物耐药位点变异。A型和B型流感病毒均未发现NAIs耐药位点变异。系统进化分析显示,B型流感病毒有5例样品NA基因和HA基因分型不一致,NA基因均为B-Victoria系,而HA基因为B-Yamagata系。结论北京地区人群A型流感病毒均对金刚烷胺类药物耐药,但A型和B型病毒均未检测出NAIs耐药变异。B型流感病毒流行株中存在B-Yamagata系和B-Victoria系重组病毒株。
[Abstract]:Objective to analyze the genetic variation of neuraminidase (neuraminidase NAA) gene of H1N1 H1H3N2 and influenza B virus in Beijing in 2013-2014. RNA was extracted from nasal / pharyngeal swab samples of 37 patients with influenza virus infection. The genotype / subtype of influenza virus was detected by fluorescence quantitative PCR. The na and matrix protein M2M2) gene fragment of influenza A virus and the na and hemagglutinin (HA) gene fragment of influenza B virus were amplified by reverse transcription PCR. Direct DNA sequencing. Using Mega software to construct phylogenetic tree to analyze the evolution of virus. Results 29 cases of influenza A virus were detected in 37 patients, including 23 cases of H1N1 and 6 cases of H3N2. 8 cases of influenza B virus. All influenza viruses of type A developed M2 gene S31N amantadine drug resistance site variation. No mutation of NAIs resistance site was found in type A and B influenza viruses. Analysis shows. In 5 cases of influenza B virus, na gene and HA gene were all B-Victoria lines. Conclusion all influenza A viruses in Beijing area are resistant to amantadine drugs. But neither type A virus nor type B virus detected the recombinant strains of B-Yamagata strain and B-Victoria strain in the NAIs resistant variant.
【作者单位】： 广东医学院检验学院生物化学与分子生物学研究所;解放军第302医院临床研究管理中心;
【基金】：北京市科委科技计划项目(D131100005313016) 新发突发传染病研究北京市重点实验室资助项目(2014XFTF04) 全军医学科技“十二五”科研项目重点课题(BWS11J048)~~
【分类号】：R511.7
【正文快照】： 流感病毒可在全球范围内大流行或呈季节性流行,威胁公共卫生安全。流感病毒属于正黏病毒科(orthomyxoviridae),是有包膜的单股负链RNA病毒,共8条RNA链,编码11种蛋白质,根据核衣壳蛋白抗原性的不同,分为甲(A)、乙(B)、丙(C)3型。A型流感病毒根据膜表面的糖蛋白血凝素(hemagglut
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，本文编号：1445804
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