秋冬型恙虫病疫区扩散的流行病学特征与机制研究

发布时间：2018-02-08 16:56

  本文关键词： 恙虫病 恙虫病东方体 秋冬型 流行病学特征 疫区扩散　出处：《山东大学》2014年博士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：背景 恙虫病是由恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi, Ot)感染所致的一种自然疫源性疾病,广泛流行于亚洲太平洋沿岸约1300万平方公里的地区,全球每年约10亿人有感染恙虫病的风险。鼠类是主要贮存宿主,恙螨为传播媒介。我国属于恙虫病重点疫区之一。在我国,恙虫病原仅在北纬31°以南的广大地区流行,以夏季型为主。长江以北地区自1986年在山东首次发生流行以来,新疫区不断形成和扩散,流行季节主要为秋冬季。病原体的遗传变异、生态旅游的发展以及疾病流行强度和疾病负担的低估,成为恙虫病研究新的推动力。监测恙虫病流行特征的改变,探讨该病疫区迅速扩散和疫情变化的特征和影响因素,对丰富恙虫病的病原学、流行病学理论及该病的诊断和预防控制具有重要意义。 目的 本研究通过对秋冬型恙虫病新、老疫区之间宿主动物和媒介的种属构成和分布特点、Ot型特异性抗原编码基因的变异特点和规律以及恙虫病的人群流行和感染特征进行比较与分析,探讨秋冬型恙虫病疫区扩散的流行病学特征与机制,从而为恙虫病的流行趋势预测提供重要线索,为该病的预防控制和诊断治疗提供科学依据。 材料与方法 自山东省秋冬型恙虫病老疫区选取沂南县、沂水县,自新疫区选取新泰市、岱岳区、即墨市及胶南市为调查点。2010年9月至2012年3月,一年四季在各调查点捕获宿主动物,采集宿主动物脾脏、肝脏和耳内寄生恙螨,对宿主动物和恙螨进行种属鉴定并计数,计算宿主动物的带螨率和带螨指数。自动物脾(肝)脏和恙螨中提取基因组DNA,应用巢式PCR检测标本中的Ot DNA,对56kDa型特异性抗原(type-specific antigen, TSA)编码基因进行扩增并测序,与自Genbank中获取的参考序列建立数据库,采用Mega5.0软件进行序列比对,以neighbor-joining(NJ)法Kimura2-parameter distance模型构建系统发生树。采用Lasergene7.1软件对Ot56kDa TSA核苷酸序列及其推导的氨基酸序列进行同源性分析。采用BEAST1.7.4软件基于贝叶斯蒙特卡洛马尔科夫链(Bayesian Markov Chain Monte Carlo, MCMC)算法对Ot56kDa TSA编码序列进行进化遗传学分析,对序列的进化速率、分化时间、最近共同祖先时间(the time to the most recent common ancestor, TMRCA)和分子钟模型进行估计。计算宿主动物的Ot阳性率和恙螨的最小阳性率。对秋冬型恙虫病新、老疫区宿主动物、媒介的种属构成、Ot携带状况以及Ot TSA编码基因特征进行比较与分析。 根据山东省疾病报告信息系统(Shandong Disease Report Information System, SDRIS)2006-2013年山东省恙虫病疫情数据,描述山东省恙虫病的人群分布特征和季节分布特征。自2010年1月至2011年12月,采集恙虫病病例急性期抗凝全血和自然脱落的焦痂标本,进行Ot DNA检测、型特异性扩增和TSA编码基因序列分析。2010年自调查点的监测医院选取恙虫病确诊病例进行感染特征的现况调查,对新、老疫区恙虫病的临床特征进行比较分析。采用Epidata3.1软件建立数据库,采用Excel和SPSS16.0软件进行统计分析。 结果 1.宿主种属构成及感染状况 在恙虫病新疫区捕获小兽类1158只,包括褐家鼠(58.4%)、黑家鼠(16.3%)、小家鼠(24.2%)、黑线姬鼠(0.7%)、大仓鼠(0.2%)和，

本文编号：1495919