儿童与成人慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒Core基因区准种特征及正选择压力差异分析

发布时间：2018-05-03 06:03

  本文选题：乙型肝炎病毒 + Core基因区　； 参考：《遗传》2015年05期

【摘要】：儿童与成人慢性乙型肝炎患者的临床特征差异明显。乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)病毒准种特征与其致病特性紧密相连,HBV病毒Core基因区富含免疫表位,该区域的准种特征直接反映病毒变异与病毒应对宿主免疫压力间的动态过程。文章通过扩增170名儿童慢性乙型肝炎患者及121名成人慢性乙型肝炎患者病毒Core基因区,按照病毒基因型以及病毒e抗原(Hepatitis B virus e antigen,HBe Ag)状态进行分组,使用序列复杂度、多样性、非同义突变率(Non-synonymous substitution ratio,d N)、同义突变率(Synonymous substitution ratios,d S)等指标衡量不同组别之间的病毒准种特征;使用不同模型计算不同组别中受到正选择压力的位点,进一步结合HBV Core基因区免疫表位信息,进行正选择位点的定位分析。结果发现,儿童乙型肝炎病毒患者体内病毒Core基因区序列复杂性和多样性低于成人患者,且前者Core基因区正选择位点个数显著低于后者,这说明儿童慢性乙型肝炎患者体内病毒受到的选择压力低于成人患者。在儿童及成人慢性感染病人组中,HBe Ag阳性病人体内病毒受到的选择压力低于HBe Ag阴性病人。儿童及成人慢性感染患者体内病毒存在13个正选择位点,大多数正选择位点位于已知的抗原表位上。本研究从分子进化角度揭示了儿童与成人慢性乙型肝炎病例体内病毒Core基因区序列准种差异,为两类病人显著不同的临床表征提供了群体遗传学的解释。
[Abstract]:The results showed that the sequence complexity and diversity of HBV core gene region in children and adult patients with chronic hepatitis B were lower than those in adult patients .

【作者单位】： 重庆医科大学 感染性疾病分子生物学教育部重点实验室;重庆医科大学附属第二医院检验科;
【基金】：十二五国家传染病重大专项(编号:2013ZX10002002) 重庆市科委基础与前沿研究计划(编号:cstc2013jcyj C10002)资助
【分类号】：R512.62;R725.1

【共引文献】

相关期刊论文 前10条

1 林沪;李元元;王福生;;血清HBsAg和HBeAg水平变化与慢性乙型肝炎患者抗病毒疗效预测[J];实用肝脏病杂志;2014年01期

2 谢震宇;傅益飞;浦蕊;丁一波;沈秋霞;殷建华;张宏伟;孙乔;;上海市浦东新区乙型肝炎病毒母婴传播的发生率及其影响因素研究[J];第二军医大学学报;2014年06期

3 罗杰;崇雨田;;乙型肝炎病毒准种异质性与抗病毒治疗的关系[J];广东医学;2014年19期

4 洪宇;;乙型肝炎病毒c抗原特异性T细胞系的建立及CTL克隆的筛选[J];重庆医学;2015年02期

5 滕旭;林乐勋;陈丽玲;梁爽;徐晖;谷鸿喜;;乙型肝炎病毒核苷类似物交叉耐药株RT区变异分析[J];国际检验医学杂志;2015年09期

6 董杰;申焕君;杨晓菲;赵荣荣;张野;赵燕燕;黄长形;连建奇;;T细胞免疫球蛋白黏蛋白分子3与HBV感染的研究进展[J];临床肝胆病杂志;2014年09期

7 金国贤;刘莹;金硕;;乙肝的中医病机及干扰素治疗慢性乙型肝炎对患者细胞免疫功能的影响[J];环球中医药;2014年S1期

8 冼永超;程书权;倪辉;黄成军;;不同HBeAg状态下慢性乙型肝炎患者肝组织内CD4~+、CD8~+、CD20~+、CD57~+ T淋巴细胞的表达分析[J];临床肝胆病杂志;2015年04期

9 Luis P Villarreal;Guenther Witzany;;Rethinking quasispecies theory: From fittest type to cooperative consortia[J];World Journal of Biological Chemistry;2013年04期

10 刘金涛;;乙型肝炎病毒外膜大蛋白检测的应用价值及其研究进展[J];检验医学;2014年02期

相关博士学位论文 前2条

1 倪红霞;乙肝病毒母婴传播的病毒变异规律与乙肝疫苗免疫保护效果研究[D];第二军医大学;2013年

2 蒋跃明;乙肝病毒系统发育关系构建与碱基替换形式趋异研究[D];复旦大学;2013年

相关硕士学位论文 前10条

1 王响;新生与成年土拨鼠肝组织中部分差异表达的基因比较分析[D];北京协和医学院;2013年

2 荣海燕;新疆地区乙型肝炎患者HBV基因型与耐药变异的相关性研究[D];新疆医科大学;2013年

3 马其欢;基于深度测序从全基因组分析母子患者血清HBV准种多态性[D];重庆医科大学;2013年

4 吴晓莉;拉米夫定治疗慢性乙型肝炎患者BCP/PC区准种与复发的关系研究[D];广西医科大学;2014年

5 王保健;拉米夫定治疗慢性乙型肝炎患者HBV DNA P区准种特点与复发的关系研究[D];广西医科大学;2014年

6 刘娜娜;慢性乙型肝炎患者DC表面HLA-Ⅱ分子表达模式及其效应研究[D];第三军医大学;2014年

7 黄成;依从性对慢性乙型肝炎患者服用核苷类似物出现耐药的影响研究[D];重庆医科大学;2014年

8 肖桂娥;广州地区丙型肝炎患者的HCV基因型相关研究[D];广州医科大学;2014年

9 唐黎;阿德福韦酯规范化治疗停药后复发慢性乙型肝炎患者的病毒准种分析[D];泸州医学院;2014年

10 张硕;乙型肝炎疫苗免疫失败人群HBV S基因特征分析[D];中国疾病预防控制中心;2014年

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 吕桢，董辉，谭包生，，李青，朱宣智;Core－Vent核孔型与ITI螺旋型种植体的临床近期观查[J];北京口腔医学;1996年01期

2 ;[J];;年期

3 ;[J];;年期

4 ;[J];;年期

5 ;[J];;年期

6 ;[J];;年期

7 ;[J];;年期

8 ;[J];;年期

9 ;[J];;年期

10 ;[J];;年期

相关重要报纸文章 前1条

1 胡宝钗;英特尔Core i7登场 宣告DDRⅢ时代来临[N];大众科技报;2008年

相关硕士学位论文 前1条

1 李晖;福建地区HCV基因型及Core蛋白的差异研究[D];福建医科大学;2006年

本文编号：1837275