山核桃群体结构及多样性的研究

发布时间：2016-11-23 07:03

  本文关键词：SNP研究概况及其在传染病学领域的应用，由笔耕文化传播整理发布。

《浙江林学院》 2008年

山核桃群体结构及多样性的研究

郭金剑  

【摘要】：本文采用扩增片段多态性(AFLP)和微卫星(SSR)分子标记,研究了我国特有、浙江省重要的经济树种山核桃(Carya cathayensis)的群体结构与遗传多样性。主要研究结果如下: 建立了适合于山核桃叶片AFLP分析的体系,该体系的要点如下:(1)改良CTAB法适用于从山核桃叶中提取高质量的DNA,提取的DNA可用于AFLP的分析。(2)采用EcoR I/MseⅠ酶切组合,酶切与接头连接一步完成。(3)从256对引物中筛选适合于山核桃叶AFLP分析的引物组合为E-ACG+M-CTG、E-AAT+M-CCC、E-AGT+M-CCC、E-AGT+M-CGT、E-AAT+M-CGA、E-AGA+M-CCA、E-AGT+M8CCA、E-AGA+M-CGC。扩增产物经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后进行银染,条带信号强度一致性好,条带分布均匀、清晰,分辨率较高。 用8对AFLP引物在100个来自天然群体的山核桃样品中共产生了32个多态标记,说明山核桃多态性水平低。两点分析获得495个标记组合,其中60个组合具有显著的LD,占所有分析标记组合的12.10%;三点分析获得4952个标记组合,其中779个组合具有显著的LD,占所有分析标记组合的15.70%。 研究结果表明,山核桃天然群体中存在显著的连锁不平衡(LD),等位基因间紧密连锁,重组率低,杂合度低,遗传多样性水平低。目前山核桃的分布具有极强的地域性,与我国其它的山核桃属的种是分离的,没有基因交流,推断山核桃群体在进化发育过程中经历了瓶颈过程,并伴随着显著的遗传漂移,这个过程可以产生显著的LD。山核桃半同胞在分子水平与母本相似,可能多数位点对的LD源自母本,存在同型配对,可能有孤雌生殖的现象存在。 山核桃作为一种木本经济树种,其天然群体AFLP分析数据的LD分析,支持了邬荣领研究小组所发展的适用于代表性不足的林木用显性标记来估计、检测连锁不平衡的模型,是该模型在林木中的具体应用,同时也验证了“三点分析可以更好地估计连锁不平衡,且与二点分析相比,在检测连锁不平衡方面能力更强”的观点。 山核桃母本与半同胞AFLP分析结果也表明,山核桃DNA水平多态性程度很低,母本与子代间几乎没有差异。 美国人在美国山核桃中开发的19对SSR引物不适用于山核桃,尽管山核桃与美国山核桃为同属的两个种。

【关键词】：
【学位授予单位】：浙江林学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2008
【分类号】：S664.1
【目录】：

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1 宋双;黄银芝;董雷鸣;黄有军;曾燕如;吴智敏;;山核桃SSR标记的初步开发[J];浙江农林大学学报;2012年04期

【参考文献】

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1 张鹏飞;刘亚令;张燕;张琰;吴国良;;核桃无融合生殖现象及其矿质营养变化研究[J];安徽农业科学;2006年10期

2 张扬,黄炳超,谢振文,肖汉祥,John Bennett;应用AFLP分析广东稻瘿蚊不同生物型DNA指纹[J];广东农业科学;2005年01期

3 宣继萍,章镇,房经贵,高志红,车胜利;苹果品种ISSR指纹图谱构建[J];果树学报;2002年06期

4 吴锦程;杨向晖;林顺权;;枇杷AFLP分析体系的建立与应用[J];果树学报;2006年05期

5 张萍;SNP研究概况及其在传染病学领域的应用[J];国外医学(流行病学传染病学分册);2002年03期

6 黎章矩,钱勤,沣旗进;山核桃花芽分化与开花习性的初步研究[J];经济林研究;1984年01期

7 王绍忠,方向宁;安徽山核桃调查报告[J];经济林研究;1991年01期

8 周根土;浅议大别山区山核桃分布与开发[J];经济林研究;1998年02期

9 王文明,周永力,江光怀,马伯军,陈学伟,章琦,朱立煌,翟文学;水稻抗白叶枯病基因Xa-4的精细定位及其共分离分子标记[J];科学通报;2000年10期

10 李虹,卢孟柱,蒋湘宁;表达序列标签(EST)分析及其在林木研究中的应用[J];林业科学研究;2004年06期

中国硕士学位论文全文数据库 前2条

1 徐小林;栓皮栎群体遗传结构研究[D];南京林业大学;2003年

2 徐川梅;普通小麦—簇毛麦2V染色体端体异附加系和易位系的选育与鉴定及分子原位杂交技术的应用[D];南京农业大学;2006年

【共引文献】

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1 郑红军;孙明远;宋福林;魏海蓉;李勃;;核果类果树分子标记研究进展[J];山东农业科学;2006年04期

2 张林;樊庆琦;隋新霞;楚秀生;李根英;程敦公;黄承彦;;小麦部分重要性状分子标记研究进展[J];山东农业科学;2008年07期

3 王娜;徐明举;王超;郭梁;孙家正;田长平;陈学森;;早实核桃实生后代部分性状的遗传变异[J];山东农业科学;2010年07期

4 苑兆和;张春雨;尹燕雷;冯立娟;招雪晴;王金政;安国宁;;山东主栽杏品种分子遗传多样性研究[J];山东农业科学;2010年11期

5 王红艳,张胜义,郜洪文;DNA-夜蓝结合光谱研究[J];安徽大学学报(自然科学版);2003年03期

6 王宗宽;曹炜;夏强强;沈青;何福基;王正加;;白术不同居群亲缘关系RAPD分析[J];安徽林业科技;2011年01期

7 凌经球,刘孝云,陆伦东,丁亚斌;歙县山核桃生产现状、问题与改进措施[J];安徽农学通报;2000年02期

8 邹利波;黄升谋;;月季总DNA提取方法的比较研究[J];安徽农学通报;2007年01期

9 张筠;王明昌;李妍;隋娜;董长永;;海洋动物核糖体RNA基因的结构特征和功能进化[J];安徽农学通报;2008年05期

10 郭传友;陈楚;;山核桃果实品质与土壤性质的相关分析[J];安徽农学通报;2008年21期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 韩雪萍;王永清;;DNA分子标记在枇杷种质资源分析中的应用[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文（摘要）集[C];2011年

2 龙治坚;韩国辉;党江波;梁国鲁;向素琼;;枇杷种质资源遗传多样性的SSR分析[A];第五届全国枇杷学术研讨会论文（摘要）集[C];2011年

3 马稚昱;牟英辉;辜松;;瓜类作物自动嫁接方法的研究[A];中国农业工程学会2011年学术年会论文集[C];2011年

4 宋婉;续九如;杨凯;贾继增;;AFLP技术在中国枣优良品种鉴定中的应用[A];首届全国干果生产与科研进展学术研讨会论文集[C];1998年

5 何天明;陈学森;许正;高疆生;林培钧;刘文;梁青;孟和巴图;;利用SSR标记对伊犁河谷野杏种群遗传结构的分析[A];中国园艺学会第十届会员代表大会暨学术讨论会论文集[C];2005年

6 罗淑萍;孙晋科;曾斌;李疆;;野扁桃ISSR—PCR反应体系的优化[A];第五届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2007年

7 沈志军;马瑞娟;俞明亮;宋宏峰;蔡志翔;;早熟油桃紫金红1号亲本的SSR鉴定[A];第二届全国果树分子生物学学术研讨会论文集[C];2009年

8 董海燕;侯伯鑫;;利用ISSR标记构建41个红花檵木品种指纹图谱[A];中国观赏园艺研究进展 2009[C];2009年

9 赖家业;刘凯;石海明;兰健;尹承颖;罗荡平;冯家勋;陈放;;蒜头果基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化[A];第三届南方林木育种研讨会论文（摘要）集[C];2006年

10 王莉花;叶昌荣;刘继梅;;云南荞麦野生种DNA的提取与RAPD反应体系的构建[A];云南省作物学会2004—2006年优秀论文选集[C];2006年

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1 王传堂;生物技术和近红外技术在花生育种中的应用[D];中国海洋大学;2010年

2 李培英;新疆草坪用野生偃麦草种质资源评价[D];新疆农业大学;2010年

3 何志平;浙江山核桃抗氧化与蛋白质特性研究[D];浙江大学;2011年

4 唐丽;湖南南天竹遗传多样性及园林利用评价体系研究[D];中南林业科技大学;2007年

5 文亚峰;人心果品种资源亲缘关系及其授粉亲和性的研究[D];中南林业科技大学;2006年

6 赵博;十字花科植物分子系统发育研究[D];武汉大学;2010年

7 朱彦涛;甘蓝型油菜Polima CMS和陕2A CMS的形态和生化特征及其胞质遗传物质的比较研究[D];西北农林科技大学;2010年

8 陈景堂;玉米×Teosinte远缘杂种后代重要性状的表型及遗传分析[D];河北农业大学;2011年

9 王玉山;侧柏种源遗传多样性与地理变异规律研究[D];山东农业大学;2011年

10 王丽鸳;基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D];中国农业科学院;2011年

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1 钟慧臻;荔枝果肉多酚及脂肪酸指纹图谱初步研究[D];华中农业大学;2010年

2 刘健;甘蓝型油菜C2连锁群种子含油量QTL簇及品质性状的分析[D];华中农业大学;2010年

3 郑瑜;银杏核心种质构建初探[D];华中农业大学;2010年

4 吴茜;中国香菇自然种质遗传多样性SRAP和IGS2分析[D];华中农业大学;2010年

5 贾波;山东木瓜主栽品种的植物学性状及果实品质研究[D];山东农业大学;2010年

6 王娜;早实核桃自然实生后代部分表型性状的遗传变异研究[D];山东农业大学;2010年

7 王妍炜;砀山酥梨休眠枝条~(60)Coγ射线辐射诱变及其分子检测[D];安徽农业大学;2010年

8 解文飞;尼日利亚非洲蜂和本地意蜂及其杂交二代形态特征与微卫星DNA遗传多样性研究[D];安徽农业大学;2010年

9 陈满元;水稻高代回交导入系群体抗旱相关性状的QTL定位研究[D];安徽农业大学;2010年

10 朱守晶;~（60）Coγ辐射诱变小麦农艺品质性状的遗传变异研究[D];安徽农业大学;2010年

【同被引文献】

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1 张彤;屈淑平;崔崇士;;SRAP标记在蔬菜作物遗传育种中的应用[J];东北农业大学学报;2009年01期

2 沈林;郭金剑;李阳;曾燕如;;基于AFLP分析的山核桃群体结构及遗传多样性[J];福建林业科技;2009年04期

3 朱宏波,方宣钧,杨仁崔;利用水稻基因组序列数据开发SSR标记的方法[J];分子植物育种;2003年02期

4 陈海梅,李林志,卫宪云,李斯深,雷天东,胡海洲,王洪刚,张宪省;小麦EST-SSR标记的开发、染色体定位和遗传作图[J];科学通报;2005年20期

5 庄丽芳;宋立晓;冯祎高;钱保俐;徐海滨;裴自友;亓增军;;小麦EST-SSR标记的开发和染色体定位及其在追踪黑麦染色体中的应用[J];作物学报;2008年06期

6 洪彦彬;陈小平;刘海燕;周桂元;李少雄;温世杰;梁炫强;;源于大豆EST的花生属(Arachis)同源SSR标记的开发及利用[J];作物学报;2010年03期

7 忻雅;崔海瑞;卢美贞;姚艳玲;金基强;林容杓;崔水莲;;白菜EST-SSR信息分析与标记的建立[J];园艺学报;2006年03期

8 张智俊;管雨;杨丽;余利;罗淑萍;;毛竹EST资源SSR标记分析与筛选[J];园艺学报;2011年05期

9 常玮;赵雪;李侠;邱波;韩英鹏;縢伟丽;李文滨;;大豆EST-SSR标记开发及与Genomic-SSR的比较研究[J];中国油料作物学报;2009年02期

10 王正加,黄坚钦,郭传友,杨萍,王华芳;山核桃RAPD反应体系的优化[J];浙江林学院学报;2003年04期

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1 黄有军;山核桃成花机理研究[D];南京林业大学;2010年

2 刘贯水;毛竹SSR位点引物开发及部分竹种系统学分析[D];中国林业科学研究院;2010年

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1 李元春;基于分子标记的山核桃生殖特性研究[D];浙江农林大学;2011年

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1 许晓风,程遐年,邹运鼎;褐飞虱不同生物型基因组DNA的RAPD分析[J];安徽农业大学学报;2000年01期

2 鲁小珍;马尾松、栓皮栎生长盛期树干液流的研究[J];安徽农业大学学报;2001年04期

3 韩海荣,姜玉龙;栓皮栎人工林光环境特征的研究[J];北京林业大学学报;2000年04期

4 翟洪波,李吉跃,姜金璞;元宝枫栓皮栎苗木水力结构特征的对比研究[J];北京林业大学学报;2002年04期

5 李进，陈可咏，李渤生;川滇高山栎群体遗传结构的初步研究[J];北京林业大学学报;1997年02期

6 樊路，韩敬花;普通小麦近缘种属中的控制染色体配对基因[J];北京农业科学;1994年01期

7 丁平海;沙立杰;郗荣庭;;核桃苗木枝接愈合过程观察[J];河北农业大学学报;1986年04期

8 赵学锋,蒋建平,张裕清;桑叶中DNA的含量及桑品种间的差异[J];蚕业科学;1984年03期

9 向仲怀，张孝勇，余茂德，柯益富;采用随机扩增多态性DNA技术（RAPD）在桑属植物系统学研究的应用初报[J];蚕业科学;1995年04期

10 窦全文,沈裕琥,王海庆;栽培燕麦和野燕麦C-带核型比较[J];草业学报;2004年04期

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1 金来武;刘伟成;潘争艳;裘季燕;刘学敏;;拮抗链霉菌AFLP分析技术体系的研究[J];安徽农业科学;2009年18期

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3 孟淑春;张海英;郑晓鹰;刘玉梅;王永健;;大白菜基因组DNA的提取及AFLP反应体系的建立[J];分子植物育种;2008年02期

4 陈红;张雷;吕晓贞;孙永山;郑林;臧德奎;;适于木瓜属植物AFLP分析用DNA提取方法研究[J];北方园艺;2008年12期

5 刘震;牛晓锋;秦素玲;王艳梅;杜宗现;王伟;;悬铃木AFLP分子标记技术体系的建立[J];河南农业大学学报;2010年03期

6 刘卫国;易干军;张秋明;刘岩;;菠萝DNA的提取及AFLP反应体系的建立[J];果树学报;2006年01期

7 李勇慧;耿惠敏;押辉远;;适于AFLP分析的盾叶薯蓣DNA的提取方法[J];河南农业科学;2010年01期

8 杨清;苏光荣;韩蕾;王正良;孙启祥;彭镇华;;版纳甜龙竹DNA提取方法及AFLP反应体系建立研究[J];华北农学报;2010年S1期

9 王富荣;赵剑波;章镇;佟兆国;姜立杰;姜全;张开春;;适于AFLP分析用的桃成熟叶片DNA提取方法[J];果树学报;2006年04期

10 李冬波;李江舟;朱建华;;适宜AFLP分析的龙眼基因组DNA提取方法[J];西南农业学报;2007年03期

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1 温春秀;吴志明;田伟;刘铭;周巧梅;谢晓亮;;丹参不同种质资源AFLP指纹系谱分析及其应用[A];2006海峡两岸暨CSNR全国第七届天然药物资源学术研讨会论文集[C];2006年

2 黄文坤;郭建英;万方浩;高必达;彭德良;谢丙炎;;紫茎泽兰群体遗传多样性及遗传结构的AFLP分析[A];生物入侵与生态安全——“第一届全国生物入侵学术研讨会”论文摘要集[C];2007年

3 陈晓静;李广苹;申艳红;;漳州水仙单染色体文库的构建及其AFLP标记的研究[A];中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2011年

4 黄特跃;商晗武;高永生;崔旭红;于奎峰;;加拿大一枝黄花AFLP反应体系的建立及居群间遗传多样性分析[A];第二届全国生物入侵学术研讨会论文摘要集[C];2008年

5 廖华俊;宁志怨;董玲;江芹;李卫文;张雪娇;;马铃薯钴60辐照后代基因遗传变异的AFLP分析[A];中国园艺学会2011年学术年会论文摘要集[C];2011年

6 杨锦红;刘洋;蒋伟燕;李方去;李向阳;;肺炎链球菌的AFLP基因分型和同源性研究[A];2011年浙江省检验医学学术年会论文汇编[C];2011年

7 李鸣;谭裕模;李杨瑞;李容柏;高国庆;;用AFLP分子标记技术鉴定甘蔗品种[A];中国作物学会甘蔗专业委员会第十一次学术讨论会论文集[C];2004年

8 郑嫩珠;黄虹虹;陈晖;朱志明;缪中纬;李盛霖;董晓宁;;半番鸭AFLP标记与羽色性状的关联分析[A];福建省畜牧兽医学会2009年学术年会论文集[C];2009年

9 刘朝辉;曾华兰;叶鹏盛;何炼;张骞方;韦树谷;李琼英;;改良SDS法提取棉花叶片总DNA及AFLP体系建立[A];中国棉花学会2011年年会论文汇编[C];2011年

10 张小军;徐凌飞;吴中营;;六月酥梨AFLP技术体系的建立及优化[A];梨科研与生产进展（五）[C];2011年

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1 本报记者 周兆木　通讯员 徐军 管光前;[N];中国环境报;2009年

2 临安记者站 管光前　王维;[N];杭州日报;2009年

3 大杜杜;[N];中华工商时报;2009年

4 孙键韵;[N];中国绿色时报;2010年

5 记者 吴永辉　通讯员 刘亮;[N];陇南日报;2010年

6 临安记者站 管光前;[N];杭州日报;2010年

7 临安记者站 管光前　通讯员 朱永军;[N];杭州日报;2010年

8 吴志辉;[N];中国绿色时报;2011年

9 记者 张健康　何晓玲 通讯员 张慧;[N];中国绿色时报;2011年

10 李玉胜;[N];中国绿色时报;2011年

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1 宁红;玉米弯孢菌叶斑病菌检测技术及遗传多样性研究[D];四川大学;2002年

2 逯晓萍;高丹草遗传图谱构建及重要农艺性状的基因定位研究[D];内蒙古农业大学;2005年

3 马守才;小麦多子房性状的遗传研究及AFLP分子标记[D];西北农林科技大学;2005年

4 赵辉;玉米大斑病菌（Exserohilum turcicum）生理分化和遗传多态性研究[D];沈阳农业大学;2009年

5 刘振虎;中国苜蓿品种资源遗传多样性研究[D];北京林业大学;2004年

6 杨元明;四川省玉米杂交种种质研究[D];四川农业大学;2004年

7 李振侠;苹果砧木耐盐突变体的筛选及其鉴定[D];河北农业大学;2006年

8 王保通;中国小麦条锈菌优势种群预测及主要流行菌系的AFLP指纹分析[D];西北农林科技大学;2007年

9 郑红梅;西藏几种嵩草种子萌发特性与分子系统发育研究[D];西北农林科技大学;2008年

10 申雪艳;孔雀鱼微卫星DNA标记的研制及其遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2007年

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1 刘丹;小麦光腥黑粉菌（Tilletia foetida）AFLP分析及其种的特异性SCAR标记的发掘[D];四川农业大学;2005年

2 郭金剑;山核桃群体结构及多样性的研究[D];浙江林学院;2008年

3 贾璇;小麦抗叶锈基因Lr38的AFLP分子标记[D];河北农业大学;2003年

4 温小杰;我国陆地棉抗枯黄萎病品种遗传多样性分析[D];河北农业大学;2004年

5 洪丕征;刺槐耐盐优良无性系初步选育及AFLP遗传多样性分析[D];山东农业大学;2011年

6 廖勇;AFLP分子标记与米产量杂种优势的关系的研究[D];中国农业大学;2003年

7 潘文嘉;利用AFLP技术对谷子抗锈基因进行分子标记[D];河北农业大学;2010年

8 朱肖艳;嫁接对西瓜品质性状的影响及AFLP多态性分析[D];河南大学;2011年

9 沈恩健;利用AFLP和SSR对南海区域马氏珠母贝群体的遗传结构分析[D];广东海洋大学;2010年

10 赵宏;我国棉花抗枯黄萎病部分骨干品种的AFLP研究[D];河北农业大学;2002年

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本文编号：187701