内蒙古布鲁氏菌病流行病学调查与布鲁氏菌基因分型方法的比较研究

发布时间：2018-05-19 06:08

  本文选题：布鲁氏菌病 + 横断面调查　； 参考：《中国疾病预防控制中心》2014年硕士论文

【摘要】：目的：估计内蒙古自治区布病的血清学患病率以及布病阳性家庭所占的比例,了解家庭对布病知识的认知情况。分析引起布病感染的危险因素,为制定适合牧区人群的布病预防干预措施提供科学依据。定性和定量评价布鲁氏菌的串联重复序列和多位点序列分型方法,为我国的布鲁氏菌分子流行病学研究方法的选择提供科学依据。 方法：横断面调查采取多阶段抽样,首先在内蒙古四子王旗选择农区和牧区两个区,每个区随机抽取5个村,每个村随机抽取30户,对抽样家庭采取入户问卷调查。病例对照研究在察右后旗,林西县,科右中旗疾病预防控制中心布病门诊部对一定期限内的所有就诊患者进行问卷调查,并采集血样进行实验室检测。通过单因素Χ2检验和多因素logistic回归分析布病感染的危险因素。应用PCR技术对1953年到2013年分离自不同地区的212株布鲁氏菌(包括内蒙古)同时进行16个位点的串联重复序列分型(MLVA)和9个位点的多位点序列分型(MLST),对2种分型结果进行聚类判别分析和进化分析,评价两种方法的分辨能力和与传统分型结果的一致性,并结合疫情分析引起我国布病疫情的菌株间的亲缘关系。 结果： 1.在四子王旗共调查300户家庭,收集594份血清,血清学患病率为9.6%(95%CI：7.2%～12.0%)。以户为分析单位时,家庭布病阳性率为16.67%(95%CI：12.4%-20.87%)。 2.四子王旗不同年龄组的布病感染率具有统计学差异(Χ2=11.556,P=0.0414),且感染多集中在30-50年龄段的劳动人群。不同的地区(农区与牧区)患病率无统计学差异。 3.四子王旗有布病患者的家庭与无布病患者的家庭饲养绵羊(t Approximation P=0.027)和山羊(t Approximation P=0.0998)的数量在α=0.10水平下,差异具有统计学意义,且有布病患者的家庭养殖数高于无布病患者的家庭。 4.四子王旗家庭对布病感染途径的知晓率低于50%,喝煮沸的奶和用煮沸的奶制作奶制品可以预防布病的知晓率分别为3.00%和2.67%。获得布病相关防治建议的主要渠道是旗(县)CDC,占78.33%。 5.病例对照研究的三个项目旗县共收集调查问卷与血清样本各872份。病例组纳入156人,对照组纳入585人。病例与对照人口基线情况中性别(Χ2=20.997,P0.0001)、年龄(P=0.002)、职业(Χ2=15.15,P=0.0005)具有统计学差异。 6.三个旗县的病例对照研究多因素Logistic分析显示性别(女VS男：OR=0.421,95%CI=0.287-0.618)、职业(农民VS其他：OR=1.849,95%CI=0.974-3.509牧民VS其他：OR=1.604,95%CI=0.409-6.296)、喂养牲畜(不喂养VS喂养：OR=0.512,95%CI=0.295-0.888)是可能的危险因素。 7.病例对照研究认知情况调查发现调查对象知道布病是传染病的占19.28%,认为布病可以治愈的占40.62%。知晓率最高的预防布病的措施是在家畜接生时采取防护措施,为11.07%,其余预防措施知晓率不足10%。 8.应用MLVA和MLST分别将212株布鲁氏菌分为149种MLVA型和21种ST型。两种方法的分辨率Simpson指数分别为0.990(95%CI：0.988-0.992)与0.565(95%CI-0.485-0.644)。 9.143株羊种布鲁氏菌通过MLVA分型发现了9种不同的Panel1型,其中42型111株,占77.6%。内蒙古、山西和河北省羊种菌株中42型Panel1分别占78.9%,97.0%和100%。 10. MLVA最小生成树分析将2010年和2013年海南省分离的2株猪3型布鲁氏菌与20世纪60年代广西分离的猪3型布鲁氏菌聚为一簇,揭示了它们的亲缘性。MLST最大简约算法构建的无根的系统发育树揭示了羊种布鲁氏菌是一种种内变异较小的布鲁氏菌,猪种和犬种布鲁氏菌的亲缘性较近且种内变异相对较大。 11.通过建立Bayes判别模型,预测布鲁氏菌的种别信息,以评价基因分型与传统方法鉴定的布鲁氏菌结果的吻合度,结果显示MLVA预测的准确度为93.24%高于MLST的75.16%。 结论： 1.通过流行病学调查发现内蒙古调查点布病真实的疫情比上报的疫情更为严重,漏报率约为20%。 2.养殖牲畜是调查旗县布病感染的主要危险因素。具有劳动能力的青壮年人群为布病感染的高危人群,进行家畜的流产物的处理如埋掉、喂狗、随意丢弃会增加布病感染的风险。 3.调查地区人群对布病相关知识具有一定的认知,但是认知水平较低。 4. MLVA分型结果显示42型为内蒙以及我国其他地区羊种菌株主要的Panel1型别,提示我国主要流行的羊种菌株可能起源于东地中海克隆群。 5.聚类分析表明我国南方猪种布鲁氏菌引起的散发疫情具有一定的相关性。 6. MLST分型结果揭示引起我国布病流行的羊3型布鲁氏菌主要为ST8型,且种内变异较小。 7. MLVA分型分辨率高于MLST,适用于爆发调查和作为存在散发疫情的南方地区的分子流行病学监测手段。MLST可以反应种群的进化关系,适用于疫情严重的北方地区的分子流行病监测。
[Abstract]:Objective: to estimate the serological prevalence of the Inner Mongolia Autonomous Region's disease and the proportion of the disease positive families, to understand the knowledge of the disease and to analyze the risk factors for the infection of the disease, and to provide a scientific basis for the formulation of the prevention and intervention measures suitable for the population of the pastoral areas. Repetitive and multilocus sequence typing methods provide a scientific basis for the selection of Brucella molecular epidemiology in China.
Methods: multistage sampling was adopted in the cross-sectional survey. First, two districts were selected in the agricultural and pastoral areas in Siziwangqi, Inner Mongolia, and 5 villages were selected randomly in each area. 30 households were randomly selected in each village. A questionnaire survey was taken to sample families. Case control study was carried out in the outpatient department of the disease prevention and control center of the center for the disease prevention and control center of the central banner, Linxi County. A questionnaire survey was conducted for all patients in a certain period of time, and blood samples were collected for laboratory tests. The risk factors of infection were analyzed by single factor 2 test and multiple factor Logistic regression. 212 strains of Brucella (including Inner Mongolia) isolated from different regions from 1953 to 2013 were used at 16 sites at the same time. In tandem repeat sequence typing (MLVA) and multipoint sequence typing (MLST) of 9 loci, cluster discriminant analysis and evolutionary analysis of the 2 types of classification results were conducted to evaluate the resolution of the two methods and the consistency with the traditional typing results, and the relationship among the strains of the epidemic epidemic situation in China was analyzed by the epidemic analysis.
Result锛，

本文编号：1909006