南京市成人星状病毒性腹泻病原基因特征分析

发布时间：2018-05-20 09:11

  本文选题：腹泻 + 病原学　； 参考：《现代预防医学》2015年07期

【摘要】：目的对2013年南京市疑似病毒性腹泻成人门诊样本进行星状病毒核酸检测、分子分型和进化分析,为星状病毒所致成人病毒性腹泻的分子流行病学提供资料。方法收集2013年疑似病毒性腹泻门诊成人病例的腹泻物375份,用星状病毒特异性引物和探针进行荧光定量RT-PCR检测,然后对荧光定量RT-PCR阳性的样本,用一步法RT-PCR再进行星状病毒特异片段的检测。对RT-PCR产物进行双向测序和进化树分析。结果荧光定量RT-PCR共检测到9例星状病毒阳性(2.4%),其中,6例(1.6%)扩增到单一条带,测序获得449 bp的星状病毒壳蛋白基因片段序列。经比对分析,6例星状病毒中,4例为5型星状病毒,1例为1型星状病毒,1例为8型星状病毒。结论南京市星状病毒所致成人病毒性腹泻中有多种型别星状病毒,5型为优势型。
[Abstract]:Objective to detect stellate virus nucleic acid, molecular typing and evolutionary analysis in adult clinic samples of suspected viral diarrhea in Nanjing in 2013, so as to provide data for molecular epidemiology of adult viral diarrhea caused by stellate virus. Methods 375 samples of diarrhea products from adult patients with suspected viral diarrhea in 2013 were collected and detected by fluorescent quantitative RT-PCR with stellate virus specific primers and probes, and then positive samples of fluorescent quantitative RT-PCR were collected. The stellate virus specific fragment was detected by one step RT-PCR. Bidirectional sequencing and phylogenetic tree analysis of RT-PCR products were carried out. Results A total of 9 stellate virus positive individuals were detected by fluorescence quantitative RT-PCR, 6 of them were amplified into a single band, and 449 BP sequence of stellate virus capsid protein gene was obtained by sequencing. Among 6 cases of stellate virus, 4 cases were stellate virus type 5, 1 case was stellate virus type 1 and 1 case was stellate virus type 8. Conclusion there are many types of stellate virus type 5 in adult viral diarrhea caused by stellate virus in Nanjing.
【作者单位】： 南京市疾病预防控制中心;
【基金】：南京市医学科技发展计划项目(ZKX09033) 南京市卫生青年培养工程项目(QRX11127)
【分类号】：R512.5

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：1914020