新疆汉族与哈萨克族HLA-DRB1、DQB1、DPB1等位基因频率与结核病相关性研究及新基因的发现

发布时间：2019-05-18 01:27

【摘要】：目的：1、探讨新疆汉族HLA-DRB1、DQB1和DPB1基因频率与结核病的关联性,寻找与结核病可能相关的HLA易感基因。2、研究新疆哈萨克族HLA-DRB1、DQB1和DPB1基因多态性与结核病的关联,寻找与哈萨克族结核病可能相关的HLA易感基因。3、寻找HLA新等位基因。方法：1、采用回顾性病例—对照分析法,应用以DNA测序为基础的基因分型方法(PCR-SBT)对我国新疆石河子汉族92例肺结核患者和96例健康对照者在HLA-DRB1、DPB1 DQB1位点进行位点分型。2、采用同样方法,对新疆沙湾哈萨克族45例肺结核病例者和90例新疆哈萨克健康对照者分别进行HLA-DRB1DQB1及DPB1位点的等位基因分型,统计采用P检验、P值计算、单倍型计算,研究不同等位基因频率与新疆哈萨克族结核病关联性。3、采用基因克隆和DNA测序技术,对怀疑新基因样本"wp47"进行深入研究,鉴定出新的等位基因。结果：1、研究发现汉族人病例组中,HLA-DRB1*07:01、DQB1*03:01频率高于对照组(15.8% vs 8.3%,X2=4.92,P=0.027,PO.05；28.3% vs 13.5%,X2=14.144,P=0.000, P0.05);肺结核组中DPB 1*02：01基因频率明显低对照组(18.5% vs 28.1%,X2=4.877, P=0.027,P0.05)。单倍型中,DRB1*11:01-DQB1*03:01- DPB1*05:01、 DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01、DRB1*07:01-DQB1*02:02、 DQB1*03:01-DPB1*05:01和DQB1*03:03-DPB1*05:01单倍型频率病例组显著高于对照组(5.6% vs 1%,X2=5.86,P=0.015,P0.05;8.9% vs 1.6%,X2=9.964,P=0.002,P0.05； 10.9% vs 4.7%,X2=5.045,P=0.025,P0.05；15.8% vs 7.5%,=6.65,P=0.01,P0.05；9.8% vs 2.3%,X2=8.431,P=0.004,P0.05),通过检验发现病例-对照有显著差异。2、哈萨克族人群HLA-DRB1基因频率在病例组与对照组之间的差异无显著性(P0.05)；病例组DQB1*03：02基因频率明显低于对照组(3.3% vs 11.7%,X2=5.145, P=0.023,P0.05,OR:0.261[0.076-0.900]),差异具有显著性；而病例组DQB1*05：01和DPB1*04：01基因频率较对照组显著增高(13.3% vs 5.6%,X2=4.850,P=0.028,P0.05, OR=2.615,95% CI[1.084-6.312]；36.7% vs 23.3%,X2=5.317,P=0.021,P0.05,OR=1.902, [1.097-3.299] 95% CI),运用分析得出病例-对照差异显著。病例组DRB1*03:01-DQB1*02:01-DPB1*04:01单倍型频率显著高于对照组(8.9% vs 2.4%, P=0.023,P0.05,OR=4.29,95%[1.257-14.664]),统计学分析提示差异具有显著性。3、证实新等位基因：“WP47”样本DRB1基因型为HLA-DRB1*12:01,16:new.新等位基因HLA-DRB1*16:new与DRB1*16：23相比,在2号外显子第227位上AT,在第236位置上TC碱基,被国际组织指定为：DRB1*16：36。结论：1、新疆汉族人群HLA-Ⅱ,DR区的DRB1*07：01及DQ区的DQB1*03：01基因可能为结核病易感基因；DPB1*02：01基因可能是保护基因；单倍型DQB1*03:01-DPB1-*05:01、DQB1*03:03-DPB1*05:01 DRB1*11:01-DQB1*03:01-DPB1*05:01、DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01可能是汉族人群患肺结核的风险单倍型。2、在新疆哈萨克族肺结核患者与健康人群之间未发现HLA-DRB1基因频率有明显统计学差异；DQB1*03：02在健康对照组中基因频率明显增高,提示可能为哈萨克族结核病保护基因；病例组DQB1*05：01和DPB1*04：01基因频率明显高于对照组,提示可能为哈萨克族结核病易感基因,病例组DRB1*03:01-DQB1*02:01-DPB1*04:01单倍型频率显著高于对照组,统计学分析提示差异具有显著性,提示可能为哈萨克族易感单倍型。3、证实新的人类主要组织相容性复合体等位基因HLA-DRB1*16:36,并被正式命名。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：华中科技大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R52

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本文编号：2479559