西部地区鼠疫疫情趋势分析及鼠疫杆菌F1抗原表位特征预测

发布时间：2019-11-16 00:07

【摘要】：我国西部,土地辽阔,人口众多,是国家发展战略中的核心地区。近年来,伴随着经济改革开放的政策,西部地区广泛开展建设,经济发展迅猛。但是,环境和生态的变化,人口流动的增加,特别是三峡库区的修建和使用,给这些地区带来了传染病流行和暴发的威胁。目前,虽然西部的大部分地区还属于鼠疫非疫区和非病区,但是多种鼠疫疫源地穿越并包绕在这些地域。如果生态环境的变化引发了该地区鼠疫通道的快速扩展和延伸,将有可能呈现更为复杂的疫情表现特征,危害性难以估量。因此描述和分析近年来西部地区鼠疫疫源地的疫情趋势及生态特征,研究鼠疫杆菌特殊抗原成分的分子结构将有利于丰富鼠疫流行病学的理论,掌握鼠疫疫情动态,对及时、有效开展疫情控制,开展鼠疫的防治研究有着重要意义。 目的：系统分析评价我国近9年来有关西部地区鼠疫疫情、鼠疫疫源地特征及鼠疫监测的文献,以描述和了解该地区鼠疫疫源地发展趋势；通过生物信息技术探索黄胸鼠疫源地鼠疫杆菌F1抗原免疫原性效应。 方法：①制定检索策略,在PubMed、ScienceDirect、中文全文等数据库与WHO、美国CDC等官方网站上检索并纳入2000年至今的相关文献。采用定性系统分析方法严格评价纳入文献。系统分析2000-2008年西南地区鼠疫疫情趋势,疫源地地理景观特征,动物宿主及媒介特征。 ②对2003-2010年三峡库区重庆段设定的24个鼠疫监测点进行啮齿动物和媒介动物采样、鉴定。了解库区与鼠疫相关的动物、媒介的种类和密度。 ③以云南地区黄胸鼠疫源地分离的鼠疫杆菌基因序列为目标,引入NCBI、 ProtParam tool、SOPMA、BLAST、PDB、PHYRE2、SignalP4.1Server等生物信息检索及分析工具(含数据库及模型),按照生物信息原理分析F1抗原的分子结构和抗原表位。 结果：①疫情趋势的系统分析共纳入14篇文献,包括13篇原始研究,1篇综述。 ②以云南、贵州和四川为观察目的地西南地区被5种鼠疫疫源地穿越和包绕,鼠疫疫情在2000年达高峰,以后逐年下降,呈稳定趋势；四川地区疫源地有轻微活跃趋势,但无病例报道；云南,贵州同属黄胸鼠鼠疫自然疫源地,是目前我国最活跃的鼠疫自然疫源地；不同地区的同类疫源地在地理景观和动物特征方面非常近似。 ⑨2003-2010年三峡库区蓄水后,在重庆库区8个县(市)室内平均鼠密度为1.61%,优势种为褐家鼠、小家鼠、四川短尾，

本文编号：2561554