广东省人感染H7N9禽流感疫情与禽类市场污染等环境因素关系的研究

发布时间：2020-03-19 08:40

【摘要】：目的研究基于广东省2013-2017年人感染H7N9禽流感疫情的暴发模式、传播趋势和时空聚集性的特点,探索人感染H7N9禽流感疫情的发生与禽类市场污染等环境因素的关系,并量化它们对人感染H7N9禽流感疫情的影响,为人感染H7N9禽流感疫情的预测预警、风险评估提供参考,为及早提出针对性的防控策略,减少未来疫情发生和传播的风险提供科学依据。方法通过国家传染病信息报告管理系统收集广东省2013.06-2017.05期间的人感染H7N9禽流感病例个案信息,基于地理信息系统技术对我省人感染H7N9禽流感疫情的时空分布特点、空间分布格局以及时空聚集模式进行研究;以广东省2013-2017年人感染H7N9禽流感疫情季节性期间每周疫情发生与否为响应变量,选取每周疫情前一周的禽类市场环境H7亚型禽流感病毒污染数据、气象数据为预测变量,采用受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic,ROC)曲线分析预测变量的临界值。此外,以每周病例数为响应变量,采用Spearman秩相关分析响应变量与预测变量之间的相关性,利用增强回归树(Boosted Regression Tree,BRT)模型定量分析相关环境因素对每周疫情规模的相对贡献。结果(1)截至2017年5月,广东省人感染H7N9禽流感累计报告了258例实验室确诊病例。全局自相关分析结果显示,全局Moran’I指数是0.236(Z=4.089,P0.001),提示疫情总体上呈空间聚集性。标准差椭圆分析结果显示,疫情空间分布格局经历了初始于珠三角地区—沿珠三角地区向东北方向粤东地区蔓延—由粤东地区向西南方向回到珠三角地区扩散的过程。通过时空重排扫描聚类分析,发现了珠三角地区和粤东地区是两个具有显著性的疫情时空聚集区(P0.05)。(2)疫情前一周环境因素ROC曲线下面积(Area Under ROC Curve,AUC)范围在0.666-0.817(P0.001),对于区分人感染H7N9禽流感疫情发生风险有一定的准确性。疫情前一周的H7亚型禽流感病毒市场阳性率为15.10%、H7亚型禽流感病毒样品阳性率为2.24%、平均降水量为79.98mm、平均气压为1011.11hPa、平均相对湿度为75.65%、平均气温为17.30℃和平均气温差为8.22℃分别是疫情发生风险的临界值,总符合率范围在65.63%-76.56%。(3)BRT分析结果显示,训练数据的相关性为0.812,交叉验证的相关性为0.672,标准误0.051。此外,模拟值与实测值的标化平均总偏差4.266%,标化平均残差1.276%,AUC为0.886,模型拟合效果较好。广东省人感染H7N9禽流感疫情季节性期间每周病例数的前一周相关环境因素贡献率从大到小依次是H7亚型禽流感病毒市场阳性率(28.27%)、平均气温差(27.09%)、平均气温(22.07%)、H7亚型禽流感病毒样品阳性率(11.01%)、平均相对湿度(5.48%)、平均气压(4.17%)和平均累积降水量(1.90%)。其中,在对每周病例数贡献率大于5%的环境因素中,每周病例数与市场阳性率、平均气温差和样品阳性率呈正相关,与平均气温和平均相对湿度呈负相关。结论本周H7亚型禽流感病毒市场阳性率、H7亚型禽流感病毒样品阳性率、温度和湿度等环境因素对H7N9病毒在人群传播中起着重要的预警作用,可用于未来一周疫情发生风险及规模大小的短期预测判断。
【图文】：

技术路线图,疫情,药科大学,响应变量

广东药科大学硕士研究生学位论文的疫情数据，将每周病例数作为响应变量，基于人感染 H7N9 禽流感疫情是小概率事件，发病人数实际分布近似 Poisson 分布。将疫情前一周的气象因素及禽类市场 H7 亚型 AIV 环境因素作为预测变量。调用 R 语言中的 gbm 包以及 Elith编写的 BRT 方程包进行分析[39]，设置学习速率为 0.001，每次随机抽取 50%的数据进行分析，并进行 10 折交叉验证。贡献率低于 5%的因素不具有显著性。报告BRT 的标化平均总偏差和标化平均残差，使用 AUC 评估 BRT 的预测能力[34]。2.5 技术路线图

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图 3.4 广东省人感染 H7N9 禽流感病例空间分布广东省人感染 H7N9 禽流感疫情时空特点1 疫情空间自相关分析自相关分析结果显示，，广东省 2013-2017 年人感染 H7N9 禽流感疫an I 指数是 0.236（Z=4.089，P<0.001），提示疫情总体上呈空间，2013.06-2014.05 期间疫情全局 Moran I 指数是 0.229（Z=4.，疫情呈空间聚集性；2014.06-2015.05 期间疫情全局 Moran I（Z=2.886，P=0.004），疫情呈空间聚集性；2015.06-2016.05 期间an I 指数是 0.053（Z=1.107，P=0.269），疫情呈随机分布；201期间疫情全局 Moran I 指数是 0.166（Z=2.887，P=0.004），疫情。结果见表 3.1。
【学位授予单位】：广东药科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R511.7;R181.3

【参考文献】