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广西边境与非边境地区结核分枝杆菌耐药及基因型分析

发布时间:2020-09-12 10:55
   目的本研究旨在通过对广西与越南接壤的边境地区和未接壤的非边境地区2016?2017年结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)的耐药情况和基因型进行调查和比较分析,了解两地区间结核分枝杆菌耐药性和基因型的差异,为加强结核病(Tuberculosis,TB)防控、制定针对性防控措施提供参考依据。方法选取与越南接壤的、有代表性的百色、崇左、防城港作为边境监测点(边境组),选取未与越南接壤的有代表性的桂林、贵港作为非边境监测点(非边境组),于2016?2017年在结核病防治机构按照监测病例纳入标准,连续纳入登记治疗且痰涂片抗酸杆菌阳性的TB患者。收集患者的问卷信息及MTB,对MTB进行耐药性检测,并采用溶解曲线间隔区寡核苷酸分型(Melting curve analysis-based Spoligotyping,McSpoligotyping)技术进行基因分型,最后将数据录入Epidata 3.0数据库中,并用SPSS 17.0进行统计分析。结果1.广西边境与非边境地区MTB耐药情况及影响因素比较:共纳入TB患者1306例,其中边境组631例,非边境组675例。比较边境组和非边境组纳入患者的分布情况,结果显示,民族、家庭人均年收入、文化水平和患者类型在两组间的分布差异有统计学意义(P0.05),边境组和非边境组患者分别以壮族、汉族为主,边境组家庭人均年收入≤4000元、文化水平为高中以下及复治患者所占比例均高于非边境组。本次研究共检测了异烟肼(INH)、利福平(RFP)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)、氧氟沙星(Ofx)、卡那霉素(Km)共6种药物,边境组总耐药率、单耐药率、多耐药率和耐多药率(分别为:18.07%、9.51%、2.69%和5.86%)均高于非边境组(分别为:11.11%、7.70%、1.78%和1.63%),其中总耐药率和耐多药率在两组间的差异有统计学意义(P0.05);边境组对6种检测药物的任一耐药率均高于非边境组,其中INH和RFP的任一耐药率在两组间差异有统计学意义(P0.05);经单因素和多因素Logistic回归分析,结果显示,边境组和非边境组的耐药影响因素均为患者类型,复治是两组TB患者耐药的危险因素,其OR值在边境组为1.86(95%CI:1.13?3.05),在非边境组为2.72(95%CI:1.39?5.33)。2.广西边境地区与非边境地区MTB基因型比较:从边境组和非边境组各随机抽取450株MTB进行McSpoligotyping试验,共获得881株MTB的基因分型结果,其中边境组435株,非边境组446株。Spoligotyping分型结果显示,两组菌株均可分为北京基因型和非北京基因型,其中非边境组北京型菌株比例高于边境组(65.25%VS 55.63%),差异有统计学意义(P0.05);非北京型菌株中,边境组可进一步分为T族、H族、EAI族、LAM族和MANU族(所占比例分别为:22.76%、3.45%、1.84%、0.46%和0.23%),非边境组可进一步分为T族、H族和EAI族(所占比例分别为:19.51%、3.58%和0.22%),其中EAI族在两组间的分布差异有统计学意义(P0.05);基因型聚类分析结果显示,非边境组MTB基因成簇率高于边境组(80.04%VS 73.33%),差异有统计学意义(P0.05);分析北京基因型与菌株耐药的相关性,结果显示,非边境组北京基因型菌株总耐药率高于非北京基因型,差异有统计学意义(P0.05),边境组菌株耐药率在北京基因型与非北京基因型之间的分布差异无统计学意义(P0.05)。结论广西边境地区经济、文化水平低和复治的TB患者所占比例均高于非边境地区,其耐药结核病(Drug-resistant tuberculosis,DR-TB)尤其是耐多药结核病(Multiple drug-resistant tuberculosis,MDR-TB)疫情较非边境地区严峻,应予以重视;复治是两地TB患者发生耐药的危险因素;边境地区和非边境地区均以北京基因型MTB为主要流行菌株,但非边境地区北京基因型比例高于边境地区;边境地区EAI族MTB流行比例高于非边境地区;非边境地区MTB基因成簇率高于边境地区;边境地区MTB基因型与耐药性之间无关联,而非边境地区北京基因型MTB的总耐药率高于非北京基因型。
【学位单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2019
【中图分类】:R52;R181.3
【部分图文】:

类型,影响因素分析,耐药


图 1-1 边境、非边境结核分枝杆菌耐药类型构成情况Figure1-1 Composition of drug resistance types of MTB in border group and non-border group2.3 耐药影响因素分析2.3.1 单因素分析

溶解曲线,菌株,国际型,分类变量


图 2-1 典型溶解曲线结果图Figure2-1 Dissolution curve of typical results1.3 统计分析将试验所得的 43 位二进制码按 n=1、o=0 转换成 0 和 1 的格式,同对应的样本编号一起录入 Excel 表中,然后将数据表提交至国际数据库MIRU-VNTRplus (https://www.miru-vntrplus.org/MIRU/index.faces)中,与Spol DB 4.0 数据库进行比对,得到每个菌株基因所对应的 Spoligotyping 国际型别编码(SIT)和所属基因家族,并进行聚类分析,生成菌株基因型聚类球状图;统计分析软件为 SPSS 17.0,分类变量差异的比较采用χ2检验以及 Fisher 确切概率法。检验均为双侧概率检验,检验水准均为α=0.05。1.4 质量控制DNA 样本提取中,刮取菌株时应注意避免刮到培养基,吸取 DNA 上

分布情况,基因族,布图,基因型


图 2-2 边境组、非边境组各基因族群分布图Figure2-2 Distribution of various gene families in border group and non-border group2.1.2 北京基因型菌株在不同人群中的分布情况分别对边境组和非边境组北京基因型 MTB 在不同人群中的分布情况进行分析,结果显示,边境组北京基因型菌株在不同性别、年龄、现住址、职业和患者类型间分布无差异(P>0.05),但在不同民族间分布有差异,经两两比较发现汉族患者的临床分离株中北京基因型 MTB 所占比例高于壮族(χ2=6.09,P=0.014),(详见表 2-4);非边境组中北京基因型菌株在不同性别、现住址、职业和患者类型间分布无差异(P>0.05),而在不同年龄和民族间的分布有差异,表现为≥60 岁患者的临床分离株中北京基因型 MTB所占比例低于 30 59 岁患者(χ2=6.58,P=0.010)和<30 岁患者(χ2=12.28,P=0.000)、壮族患者的临床分离株中北京基因型 MTB 所占比例高于汉族

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本文编号:2817543

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