RNAi工程微藻防控登革热传毒媒介伊蚊的研究
【学位单位】:海南医学院
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:R512.8;R184.3
【部分图文】:
图 1.2 HR3 蛋白保守区域多序列比对Figure. 1.2 Multi-sequence comparison of conserved region of HR3 protein利用 ProtParam 对 HR3 核酸序列进行分析(表 1.1),HR3 蛋白质分子式为 C2341H3700N640O722S32,理论分子量为 53388.91,等电点为 5.66,半衰期为 30小时,不稳定参数为 50.99,为不稳定蛋白。组成蛋白质的氨基酸数量为 468,主要的氨基酸为:丝氨酸 Ser(41 个,占 8.8%),亮氨酸 Leu(41 个,占 8.8%),谷氨酸 Glu(32 个,占 6.8%),缬氨酸 Val(29 个,占 6.2%),天冬氨酸 Asp(29 个,占 6.2%),谷氨酰胺 Gln(28 个,占 6.0%),异亮氨酸 Ile(28 个,占 6.0%),丙氨酸 Ala(26 个,占 5.6%),苏氨酸 Thr(26 个,占 5.6%),精氨酸 Arg(26 个,占 5.6%),赖氨酸 Lys(25 个,占 5.3%),甘氨酸 Gly(22 个,占 4.7%),甲硫氨酸 Met(21 个,占 4.5%),苯丙氨酸 Phe(19 个,占 4.1%),酪氨酸 Tyr(19 个,占 4.1%),酪氨酸 Tyr(19 个,占 4.1%),
图 1.3 HR3 跨膜结构域分析Figure. 1-3 Cross-membrane domain analysis of HR3(2)昆虫 HR3 基因系统发育树HR3 基因系统发育树,总结了 HR3 基因家族的进化关系。从 GenBank 中搜索到 15 种相关昆虫的 HR3 序列,通过 MEGA7 软件构建了系统发育树(图1.4.A)。从进化树中可以看出,埃及伊蚊 HR3 基因序列与白纹伊蚊及其相似,同源率达到 99%,其次是蝇属,与玉带凤蝶的同源性最差,同源率只有 71%。利用在线工具 GSDS 绘制基因结构,如图 1.4.B 所示,外显子和内含子分别用黄色矩形和细线表示,未翻译的区域(UTRs)用蓝色框表示,底部比例尺估计外显子和内含子的大小。HR3 蛋白质结构域利用在线工具 Smart 和 Pfam 共同得出。不同的域用不同颜色的框表示,标志在右下角,借助底部的比例尺可以明确蛋白质的结构和大小(图 1.4.C)。
12图 1.6 3HKT 蛋白保守区域Figure. 1.6 Multi-sequence comparison of 3H利用 ProtParam 对 3HKT 核酸序列进行分式为 C1935H3039N519O554S25,理论分子量为 43230 小时,不稳定参数为 38.63,为不稳定蛋白。主要的氨基酸为:亮氨酸 Leu(37 个,占 9.5%)异亮氨酸 Ile(29 个,占 7.5%),丙氨酸 Ala(24 个,占 6.2%),脯氨酸 Pro(24 个,占6.2%),缬氨酸 Val(24 个,占 6.2%),精氨氨酸 Lys(19 个,占 4.9%),天冬氨酸 Asp((17 个,占 4.4%),天冬酰胺 Asn(15 个,占
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1 张阳;RNAi工程微藻防控登革热传毒媒介伊蚊的研究[D];海南医学院;2018年
本文编号:2829362
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