云南省2009-2014年流感样病例监测及分离毒株变异研究
发布时间:2020-10-12 08:01
目的对云南省2009~2014年流感样病例监测数据进行分析,建立流感样病例预测模型,预测2015年云南省流感样病例的分布趋势。了解云南省2009-2014年流感病毒HA和NA的进化和变异情况,与疫苗株的匹配和耐药位点突变情况,为防控预警预测、疫苗和抗病毒药物的使用提供参考。方法用描述性方法对云南省2009~2014年19个流感监测哨点医院的流感样病例监测资料进行分析,用采用专家建模法建立数学模型,对2015年云南省流感样病例流行趋势进行预测。对2009-2014年云南省分离的60株流感病毒株(H3N2亚型毒株25株、A/pdmH1N1亚型毒株23株和B型毒株12株)提取病毒RNA,用特异性扩增引物对流感毒株的HA和NA基因进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,提取和纯化产物,进行HA和NA基因序列测定,与参考株和疫苗株的HA和NA基因序列一起作进化分析。数据统计分析软件用SPSS17.0,用DNASTAR软件对基因序列进行剪切、拼接编辑,用MEGA5.1软件绘制基因亲缘性进化树。结果(1)2009-2014年云南省16个州市19家哨点医院门急诊就诊病例总数17308285例,其中ILI就诊病例358314,ILI%为2.07%,流感样病例以保山、昆明和红河居多,0~岁组和5-岁组(0-15岁)占ILI病例总数的60%以上,全省流感病毒分离率呈逐年递增的趋势,2009-2014年云南省流感流行优势株H3N2亚型、A/pdmH1N1亚型和B型呈交替出现的特点。用流感样病例预测模型进行预测,2015年流感样病例的分布总体平稳,可能会出现小的波动。(2)通过对2009-2014年云南省流感病毒HA和NA基因的测序分析发现,流感病毒各亚型毒株在基因亲缘性关系树中显示出明显的时间分布趋势。2009-2014年流感病毒未发现明显变异,毒株变异幅度不大,云南省流感流行株与疫苗株有较好的一致性。通过对各亚型毒株的NA序列进行分析后发现除一株毒株具有有意义的耐药位点改变,其余毒株均未发现有意义的耐药位点的出现和改变,说明流感病毒对现有临床应用的抗流感病毒的神经氨酸酶抑制剂仍然敏感。结论1.根据流感样监测数据分析和流行趋势预测,近期云南省流感样病例流行趋势趋于平稳,大幅波动可能性较小。2.2009~2014年云南省流感病毒各亚型流行株的HA和NA的基因序列未发现较大的变异。3.我国目前用的疫苗株与云南省的流行株有较好的匹配性,目前人群接种流感疫苗有较好的保护性。4.目前我省绝大多数流感流行株对现有临床应用的抗流感病毒神经氨酸酶抑制剂仍然敏感。
【学位单位】:昆明医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2015
【中图分类】:R511.7;R181.8
【部分图文】:
图1?2009-2014年ILI%时间序列图??(2)模型识别2009年受甲流大流斤影响,2009?2014年ILI%时间序列波比较大,为了消除其对建模的影响,在建模前对2010-2013年ILI%数据进行??自相关和偏相关回归分析,采用了一次季节性差分和一次差分来对数据进行处??
,处理后分析结果发现自相关图呈逐渐下降的趋势,而偏相关图为一阶截尾状??,据此判断正1%数据比较平稳,为建立模型提供了良好的前提条件。??ILI??□?Coefficient??1.沪?
图3?2010-2013年云南省ILI%的偏相关关系图??(3)模型的建立利用SPSS17.0进行预测模型建立,选择预测模型中专家??的方法由系统自动计算选择最优模型进行建模,通过计算模型选用Winters??iplicative即季节乘法来建立预测模型,由建模结果可知模型t值为14.308,??
【参考文献】
本文编号:2837878
【学位单位】:昆明医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2015
【中图分类】:R511.7;R181.8
【部分图文】:
图1?2009-2014年ILI%时间序列图??(2)模型识别2009年受甲流大流斤影响,2009?2014年ILI%时间序列波比较大,为了消除其对建模的影响,在建模前对2010-2013年ILI%数据进行??自相关和偏相关回归分析,采用了一次季节性差分和一次差分来对数据进行处??
,处理后分析结果发现自相关图呈逐渐下降的趋势,而偏相关图为一阶截尾状??,据此判断正1%数据比较平稳,为建立模型提供了良好的前提条件。??ILI??□?Coefficient??1.沪?
图3?2010-2013年云南省ILI%的偏相关关系图??(3)模型的建立利用SPSS17.0进行预测模型建立,选择预测模型中专家??的方法由系统自动计算选择最优模型进行建模,通过计算模型选用Winters??iplicative即季节乘法来建立预测模型,由建模结果可知模型t值为14.308,??
【参考文献】
相关期刊论文 前1条
1 郭潮潭,陈勇;流感病毒的受体结构与跨越物种传播的分子机制[J];国外医学.流行病学传染病学分册;2005年02期
本文编号:2837878
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