安徽省2013-2018年活禽市场H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因遗传特征

发布时间：2020-12-24 21:03

　　目的分析2013年-2018年安徽省外环境中H9N2亚型禽流感病毒（avian influenza virus, AIVs）血凝素（hemagglutinin, HA）基因变异特征。方法将所有安徽省禽流感外环境监测点搜集的H9N2亚型核酸阳性样本接种鸡胚分离病毒,病毒RNA逆转录为cDNA后用特异性引物进行扩增,聚合酶链式反应产物通过基因测序后获得HA基因序列,应用分子生物学软件进行分析;使用DATAMONKEY在线服务器进行基因选择压力分析,并使用SWISS-MODLE软件构建分子突变三维构象。结果获得33株H9N2 AIVs属于h9.4.2.5进化分支,受体结合位点183、226和227位置分别突变为N、L和M,189和190位置存在多样性;2015年以后分离的毒株均携带6个糖基化位点;选择压力分析得出160位置承受较大的正向选择压力,至少呈现7种空间构象。结论安徽省外环境中存在的H9N2亚型AIVs具有感染哺乳动物的分子特征并具备抗原漂移能力,需密切关注该病毒的分子变异特征。 

【文章来源】：中华疾病控制杂志. 2020年03期 北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

HA骨架结构的空间构象变化受因158～160氨基酸突变的影响

HA蛋白潜在糖基化位点中29～31、141～143、298～300、305～307和492～494均为稳定存在的糖基化位点,并且和以往H9N2亚型AIVs比,在313～315位置增加了一个糖基化位点,此6个糖基化位点稳定地存在于2015年以后安徽省分离的外环境毒株中。2015年以前外环境中分离的毒株中在145～147、206～208和218～220位置曾出现过糖基化位点,但随后分离的毒株中这3个糖基化位点均未再出现,见表1。表1 2013年-2018年安徽省活禽市场外环境分离H9N2亚型禽流感毒株HA基因受体结合位点和糖基化位点分析Table 1 Analysis of receptor binding sites and potential glycosylation sites in the HA gene of H9N2 AIVs isolated from external environment of live poultry markets in Anhui Province from 2013 to 2018 毒株名称 受体结合位点(H3 numbering) 潜在糖基化位点(H3 numbering)a 155 183 189 190 194 226 227 29 105 141 145 206 218 298 305 313 492 A/Environment/Anhui/08829/2013 T N T A L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/08826/2013 T N T A L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/09183/2014 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/09184/2014 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/09185/2014 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/09189/2014 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/09180/2014 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/40246/2015 T N T A L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/40248/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/40249/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38992/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38981/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38978/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38977/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/01012/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/01010/2015 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/01011/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/46666/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/42489/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/19202/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/19204/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16914/2016 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16915/2016 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/17450/2017 T N T A L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16916/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16917/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16918/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/04468/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16920/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16921/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16922/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/04713/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16924/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Duck/Hong Kong/Y280/97 T N T T L L Q + + + + + + A/Chicken/Hong Kong/G9/97 T N T A L L Q + + + + + + A/Quail/Hong Kong/G1/97 T H T E L L Q + + + + + + + + A/Chicken/Shanghai/F/98 T N T A L Q Q + + + + + + A/Chicken/Beijing/1/94 T N T V L Q Q + + + + + + 注:aHA蛋白潜在糖基化位置分别为29～31、105～107、141～143、145～147、206～208、218～220、298～300、305～307、313～315和492～494;“+”存在糖基化位点,空白表示无糖基化位点

安徽省外环境分离的H9N2亚型AIVs的HA蛋白有4个毗邻受体结合位点的糖基化位点(105～107、145～147、206～208和218～220)在进化的过程中均发生突变并消失,唯独靠近Right edge的糖基化位点141～143仍存在;、HA的158～160位置为HA蛋白高突变位点,安徽省33株外环境H9N2 AIVs位置存在7种三维构象:DGN、DNA、NNA、NGE、NGN、NGD和NSD,其中有17株病毒为“NGD”构象。见图2、图3。图3 HA骨架结构的空间构象变化受因158～160氨基酸突变的影响

【参考文献】：
期刊论文
[1]2009-2017年烟台地区甲型（H1N1）pdm09流感病毒神经氨酸酶基因进化分析[J]. 刘娟,高巧,徐迎春,孙振璐,董兆静,徐小雯,宫连凤.  中华疾病控制杂志. 2018(10)
[2]H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列测定方法的建立[J]. 何军,李晓丹,何兰,俞俊岭,苏斌.  病毒学报. 2018(01)



本文编号：2936308