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HIV感染者肠道真菌菌群分布及分泌物变化与肠粘膜损伤

发布时间:2020-12-28 18:28
  目的:对比尚未发展至AIDS期的无症状HIV感染者与健康人群肠道真菌群落、真菌分泌毒性蛋白、免疫屏障、机械屏障的差异,分析肠道真菌群落、毒性因子、免疫状态之间的相关性。探讨HIV感染者肠道真菌微生态变化与肠粘膜屏障受损的可能关联。方法:将所有入组人员分为A组、B组、对照组。A组为确诊后未治疗的无症状HIV感染者,B组为确诊后接受规范抗病毒治疗的无症状HIV感染者,对照组为健康人群。采集入组人员粪便标本及血液标本,用真菌ITS1高通量测序技术,分析三组人群肠道真菌菌落结构;用RT-qPCR技术检测三组人群肠道真菌分泌毒性蛋白基因的表达:凝集素样序列蛋白3(ALS3)、菌丝壁蛋白1(HWP1)、磷酸酯酶B1(PLB1)、聚苯乙烯黏附增强蛋白1(EaP1)、分泌型天冬氨酸蛋白酶(SAPs);用流式细胞术检测三组人群细胞免疫状态:CD4+T细胞计数(CD4)、CD4+T细胞百分比(CD4%);用酶连免疫吸附法检测三组人群血清中肠粘膜机械屏障损伤标志物的含量:脂肪酸结合蛋白(I-FABP)、D-乳酸(D-Lactata)及脂多糖(LPS)。使用SPSS... 

【文章来源】:西南医科大学四川省

【文章页数】:71 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

HIV感染者肠道真菌菌群分布及分泌物变化与肠粘膜损伤


下机数据处理流程

曲线,样本,聚类,分析图


-26-结果1三组人群肠道粪便真菌ITS1高通量测序结果:1.1测序数据:对三组人群粪便样本检测发现,共得到2209113条有效序列,序列平均长度为215.37bp。1.2OUT数分析:三组测序结果中各组所独有、共有OUT数量见下图3-A。图3:A:各组独有、共有OUT数量韦恩图;B三组间NMDS分析图,点与点之间连线的距离表示差异程度;C三组样本稀释曲线;D三组样本等级聚类曲线

柱状图,丰度,柱状图,物种


-27-1.3物种相对丰度分析:在门水平上,三组肠道粪便真菌以子囊菌门、担子菌门为主,A组这两个菌门占87.34%,B组这两个菌门占85.60%,对照组这两个菌门占92.87%。在属水平上,A组以镰刀菌属、念珠菌属、梗霉属为主,丰度分别为0.643472、0.174736、0.018045;B组以镰刀菌属、链格孢属、念珠菌属为主,丰度分别为0.652034、0.070699、0.029777;对照组以镰刀菌属、梗霉属为主,念珠菌属相对低,丰度分别为0.77856、0.069153、0.000847。在能检测到的种水平上,A组以镰刀菌、白念珠菌为主,相对丰度分别为0.642799、0.173693;在B组以镰刀菌、链格孢、白念珠菌为主,相对丰度分别为0.65131、0.070501、0.027628;在对照组以镰刀菌、梗霉菌为主,白念珠菌相对低,相对丰度分别为0.777822、0.069153、0.000478。见门、属、种水平的物种相对丰度柱状图及热图(图4、5、6),桑葚图(图7)可看出念珠菌属变化趋势较大。图4:各组门水平物种相对丰度柱状图、热图

【参考文献】:
期刊论文
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[3]2018年4月全国艾滋病性病疫情[J]. NCAIDS,NCSTD,China CDC;.  中国艾滋病性病. 2018(06)
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[5]高通量测序技术在肠道微生物宏基因组学研究中的应用[J]. 叶雷,闫亚丽,陈庆森,赵林森,龄南,庞广昌.  中国食品学报. 2016(07)
[6]假丝酵母黏附相关糖基磷脂酰肌醇锚定细胞壁蛋白的研究进展[J]. 严蕾,唐建国.  微生物与感染. 2013(03)
[7]艾滋病和艾滋病病毒感染诊断标准[J]. 邵一鸣,康来仪,汪宁,张福杰,李太生,尚红,钟平,李敬云,朱关福,郑锡文,蒋岩,赵红心,吴昊,张晓燕,朱红.  中国艾滋病性病. 2012(04)
[8]高通量测序技术及其在微生物学研究中的应用[J]. 秦楠,栗东芳,杨瑞馥.  微生物学报. 2011(04)

博士论文
[1]肠内营养对艾滋病患者肠屏障功能的影响及机制研究[D]. 郭世奎.昆明医科大学 2014



本文编号:2944198

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