拉曼光谱技术在乙型病毒肝炎血清诊断试验中的应用
发布时间:2021-01-16 02:23
目的:研究应用拉曼光谱技术通过血清检测以筛查感染乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)血清。方法:1.分别选择HBV感染血清和非HBV感染血清各20例,用拉曼光谱仪在不同波长条件下进行检测,以选择最佳实验条件。2.在上述最佳条件下,选择500例研究组血清标本、500例对照组血清标本进行检测,首先将测定的光谱图运用自适应迭代重加权惩罚最小二乘法(adaptive iterative re-weighted penalized least squares,airPLS)进行拉曼光谱中扣除荧光背景,然后运用主成分分析法(Principal Component Analysis,PCA)将处理后的拉曼光谱进行主成分特征提取,接着运用支持向量机(Support Vector Machine,SVM)进行建模和预测,粒子群优化(Particle Swarm optimization,PSO)算法代替传统的网格搜索来优化SVM的参数。最后建立感染HBV血清的诊断模型。3.采用盲法方法按照所建立的模型和运用荧光定量聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,...
【文章来源】:新疆医科大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
病例组与对照组之间的归一化平均拉曼光谱的比较
新疆医科大学硕士学位论文25图2拉曼光谱的三个主成分的三维散点图Figure2Three-dimensionalscatterplotofthethreeprincipalcomponentsoftheRamanspectrum通过PSO-SVM建立的感染HBV血清模型进行计算,其准确性为93.1%、灵敏度为100%、特异度为88%。为了进一步验证模型对感染HBV血清诊断的可靠性,我们绘制了特征ROC曲线如图4进行评估。ROC曲线下的积分区域(AUC)为0.942,其曲线下面积比较大,表明本实验建立的模型具有更高的诊断准确性。
新疆医科大学硕士学位论文26图3通过PSO-SVM建立的乙型病毒肝炎模型的ROC曲线Figure3ROCcurveofhepatitisBvirusmodelestablishedbyPSO-SVM3鉴别感染乙型肝炎病毒血清模型的验证第一实验组通过拉曼光谱技术用盲法检测了200例标本,结果如(表5)。经过计算得出:灵敏度:87%,特异度:92%,KAPPA值:0.79。表5第一实验组盲法实验结果Table5Blindexperimentalresultsofthefirstexperimentalgroup第二实验组通过拉曼光谱技术用盲法检测了400例标本,结果如表6。经过计算得出:灵敏度:80%,特异度:79%,KAPPA值:0.59。拉曼光谱结果金标准合计阳性阴性阳性87895阴性1392105合计100100200
本文编号:2979970
【文章来源】:新疆医科大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
病例组与对照组之间的归一化平均拉曼光谱的比较
新疆医科大学硕士学位论文25图2拉曼光谱的三个主成分的三维散点图Figure2Three-dimensionalscatterplotofthethreeprincipalcomponentsoftheRamanspectrum通过PSO-SVM建立的感染HBV血清模型进行计算,其准确性为93.1%、灵敏度为100%、特异度为88%。为了进一步验证模型对感染HBV血清诊断的可靠性,我们绘制了特征ROC曲线如图4进行评估。ROC曲线下的积分区域(AUC)为0.942,其曲线下面积比较大,表明本实验建立的模型具有更高的诊断准确性。
新疆医科大学硕士学位论文26图3通过PSO-SVM建立的乙型病毒肝炎模型的ROC曲线Figure3ROCcurveofhepatitisBvirusmodelestablishedbyPSO-SVM3鉴别感染乙型肝炎病毒血清模型的验证第一实验组通过拉曼光谱技术用盲法检测了200例标本,结果如(表5)。经过计算得出:灵敏度:87%,特异度:92%,KAPPA值:0.79。表5第一实验组盲法实验结果Table5Blindexperimentalresultsofthefirstexperimentalgroup第二实验组通过拉曼光谱技术用盲法检测了400例标本,结果如表6。经过计算得出:灵敏度:80%,特异度:79%,KAPPA值:0.59。拉曼光谱结果金标准合计阳性阴性阳性87895阴性1392105合计100100200
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