2018年广州市输入型登革病毒3型基因组全序列测定和特征分析

发布时间：2021-01-24 10:56

　　目的分析广州市2018年输入型登革热病毒3型（DENV-Ⅲ）毒生物学来源,为本地登革热防控提供科学依据和基线数据。方法通过传染病监测网络收集广州市2018年输入型DENV-Ⅲ病例,对患者急性期血清进行病毒分离培养、全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析。结果共分离到4株DENV-Ⅲ型毒株,株间核苷酸（氨基酸）同源性为91.8%～97.3%（97.6%～99.4%）;泰国输入的分离株属于G-I型,与印度尼西亚2016年分离株的距离最近;其余3株分离株属于G-Ⅲ型,在进化树上处于同一分支,分别与老挝、巴基斯坦和新加坡分离株的距离最近;经过比对,4株分离株和13株参考株的E蛋白区域有18个氨基酸位点出现替换,NS1蛋白区域有7个氨基酸位点出现替换,NS5蛋白区域有21个氨基酸位点出现替换。结论广州市2018年输入型DENV-Ⅲ毒株分属于2个不同的基因型亚群,在进化上距离较远,抗原性差异较大;通过全基因组测序和特征分析,逐步完善周边地区的病毒特征信息,为防控工作提供生物学溯源依据,具有重要意义。 

【文章来源】：现代预防医学. 2020,47(06)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

广州市2018年DENV-Ⅲ分离株基因组全序列进化树重建结果

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：2997119