广州市2018年输入性登革病毒4型全基因组序列特征分析

发布时间：2021-02-09 08:01

　　目的本文对广州市2018年输入性DENV-4型病毒的生物学来源进行分析,为本地登革热的防控提供科学依据并累积基线数据。方法通过传染病监测网络收集广州市2018年输入性DENV-4病例,对急性期患者血清进行病毒分离培养并对分离到的DENV-4毒株进行全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析。结果共分离得到5株DENV-4毒株,其中4株由泰国和柬埔寨输入的分离株均属于DENV-4基因Ⅰ型;菲律宾输入的病例分离株与其他4株亲缘性较低,属于DENV-4基因Ⅱa型;5株分离株间的核苷酸（氨基酸）同源性为90.8%（96.7%～96.9%）;经过比对,5株分离株和6株参考株的E蛋白区域有9个位点出现差异,NS1蛋白区域有14个位点出现差异,NS5蛋白区域有25个位点出现差异。结论本研究对广州地区输入性DENV-4毒株进行全基因组测定,间接地掌握周边国家地区DENV-4的基因特征,为本地登革热的防控和溯源提供基线数据,具有重要的公共卫生意义。 

【文章来源】：中国人兽共患病学报. 2020,36(03)北大核心

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

广州市2018年DENV-4分离株基因组全序列进化树重建结果

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3025328