结核潜伏感染相关蛋白Rv3407结构和功能的生物信息学分析

发布时间：2021-03-12 19:22

　　目的应用生物信息学方法预测分析结核潜伏感染相关蛋白Rv3407的结构及功能。方法从NCBI数据库中搜索结核分枝杆菌Rv3407蛋白的氨基酸序列,分别利用ProtParam、Protscale、TMHMM、PSORT、SignalP、ITASSER、NetNGlyc、NetPhos、Motif Scan、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学软件分析蛋白质的理化性质、亲（疏）水性、跨膜螺旋、亚细胞定位、信号肽,可能与之结合的配体和该配体的结合位点、糖基化、磷酸化和翻译后修饰位点及二、三级结构;采用BepiPred、ABCpred、IEDB预测分析B细胞表位,采用SYFPEITHI、RANKPEP、NetMHC、NetCTL预测分析细胞毒性T淋巴细胞（CTL）表位,采用SYFPEITHI和RANKPEP预测分析辅助性T（Th）淋巴细胞表位。结果 Rv3407蛋白共由99个氨基酸构成,分子式为C₄₇₁H₈₀₇N₁₅₅O₁₄₄S₂,不稳定指数为46.59,为亲水性不稳定蛋白;无... 

【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2020,15(08)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

MTB Rv3407蛋白的亲（疏）水性

MTB Rv3407蛋白的跨膜区预测

MTB Rv3407蛋白的信号肽预测

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3078840