安徽省GII.P16-GII.2诺如病毒暴发疫情的基因特征分析
发布时间:2021-03-15 13:00
目的了解2018年安徽省一起感染性胃肠炎暴发疫情的病原学特征。方法收集2018年10月一起急性胃肠炎病例粪便/肛拭子12份标本,采用Real-time PCR检测诺如病毒GII基因组,阳性标本经RT-PCR扩增聚合酶区和衣壳蛋白区部分基因序列,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析。结果 12份急性胃肠炎病例标本,荧光PCR检出诺如病毒核酸均为阳性,测序获得10条序列。遗传进化树显示:10条GII.2型间核苷酸序列同源性为100%,与台州参考株GII.2(GenBank登录号:MH806429,MH842206)同源性最高(同源性最高为99.47%),且处于同一分支。结论此次急性胃肠炎暴发疫情由GII.P16-GII.2诺如病毒引起,鉴于它在中国的广泛流行,应重视GII.P16-GII.2重组株在本地区诺如病毒的监测。
【文章来源】:安徽预防医学杂志. 2020,26(03)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
NoV衣壳蛋白区部分核苷酸序列进化树
NoV 聚合酶部分核苷酸序列进化树
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄山市2018年两起暴发疫情诺如病毒分子分型与基因特征分析[J]. 程鹏,史永林,杨小双,张忠心. 安徽预防医学杂志. 2019(03)
[2]安徽省急性胃肠炎疫情相关GⅡ.P17-GⅡ.17基因型诺如病毒分子特征研究[J]. 史永林,葛盈露,金晶,刘敏鸿,汪飞鹏,陈晓龙,张文艳,孙永,胡万富. 病毒学报. 2019(02)
[3]2017年安庆市急性胃肠炎暴发疫情病原体诺如病毒的鉴定及基因特征分析[J]. 刘敏鸿,金爱武,曹孟婵,史永林,李贤相,徐四清. 中国病原生物学杂志. 2018(09)
[4]安徽省诺如病毒G II.4/Sydney 2012变异株分子特征分析[J]. 史永林,张文艳,金晶,周伟,汤仁树,吴金菊,靳淼,胡万富. 安徽预防医学杂志. 2016(06)
[5]安徽省诺如病毒胃肠炎暴发的分子病原学特征研究[J]. 史永林,孔翔羽,靳淼,方金才,施旭东,胡万富. 中华实验和临床病毒学杂志. 2015 (04)
[6]我国诺如病毒感染性腹泻流行现状及防制措施建议[J]. 张静,常昭瑞,孙军玲,廖巧红,邢薇佳,刘凤凤. 疾病监测. 2014(07)
本文编号:3084222
【文章来源】:安徽预防医学杂志. 2020,26(03)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
NoV衣壳蛋白区部分核苷酸序列进化树
NoV 聚合酶部分核苷酸序列进化树
【参考文献】:
期刊论文
[1]黄山市2018年两起暴发疫情诺如病毒分子分型与基因特征分析[J]. 程鹏,史永林,杨小双,张忠心. 安徽预防医学杂志. 2019(03)
[2]安徽省急性胃肠炎疫情相关GⅡ.P17-GⅡ.17基因型诺如病毒分子特征研究[J]. 史永林,葛盈露,金晶,刘敏鸿,汪飞鹏,陈晓龙,张文艳,孙永,胡万富. 病毒学报. 2019(02)
[3]2017年安庆市急性胃肠炎暴发疫情病原体诺如病毒的鉴定及基因特征分析[J]. 刘敏鸿,金爱武,曹孟婵,史永林,李贤相,徐四清. 中国病原生物学杂志. 2018(09)
[4]安徽省诺如病毒G II.4/Sydney 2012变异株分子特征分析[J]. 史永林,张文艳,金晶,周伟,汤仁树,吴金菊,靳淼,胡万富. 安徽预防医学杂志. 2016(06)
[5]安徽省诺如病毒胃肠炎暴发的分子病原学特征研究[J]. 史永林,孔翔羽,靳淼,方金才,施旭东,胡万富. 中华实验和临床病毒学杂志. 2015 (04)
[6]我国诺如病毒感染性腹泻流行现状及防制措施建议[J]. 张静,常昭瑞,孙军玲,廖巧红,邢薇佳,刘凤凤. 疾病监测. 2014(07)
本文编号:3084222
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