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安徽省GII.P16-GII.2诺如病毒暴发疫情的基因特征分析

发布时间:2021-03-15 13:00
  目的了解2018年安徽省一起感染性胃肠炎暴发疫情的病原学特征。方法收集2018年10月一起急性胃肠炎病例粪便/肛拭子12份标本,采用Real-time PCR检测诺如病毒GII基因组,阳性标本经RT-PCR扩增聚合酶区和衣壳蛋白区部分基因序列,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析。结果 12份急性胃肠炎病例标本,荧光PCR检出诺如病毒核酸均为阳性,测序获得10条序列。遗传进化树显示:10条GII.2型间核苷酸序列同源性为100%,与台州参考株GII.2(GenBank登录号:MH806429,MH842206)同源性最高(同源性最高为99.47%),且处于同一分支。结论此次急性胃肠炎暴发疫情由GII.P16-GII.2诺如病毒引起,鉴于它在中国的广泛流行,应重视GII.P16-GII.2重组株在本地区诺如病毒的监测。 

【文章来源】:安徽预防医学杂志. 2020,26(03)

【文章页数】:4 页

【部分图文】:

安徽省GII.P16-GII.2诺如病毒暴发疫情的基因特征分析


NoV衣壳蛋白区部分核苷酸序列进化树

安徽省GII.P16-GII.2诺如病毒暴发疫情的基因特征分析


NoV 聚合酶部分核苷酸序列进化树

【参考文献】:
期刊论文
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[3]2017年安庆市急性胃肠炎暴发疫情病原体诺如病毒的鉴定及基因特征分析[J]. 刘敏鸿,金爱武,曹孟婵,史永林,李贤相,徐四清.  中国病原生物学杂志. 2018(09)
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[6]我国诺如病毒感染性腹泻流行现状及防制措施建议[J]. 张静,常昭瑞,孙军玲,廖巧红,邢薇佳,刘凤凤.  疾病监测. 2014(07)



本文编号:3084222

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