深圳市耐多药结核分枝杆菌耐药基因突变特征分析

发布时间：2021-05-10 08:53

　　目的利用全基因组序列分析方法研究深圳市耐多药结核分枝杆菌（MDR-MTB）的耐药基因突变类型特点,为耐药结核病的快速分子检测提供依据。方法对2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各区慢性病防治院门诊收集的所有449株MDR-MTB临床分离株进行全基因组测序,经与结核分枝杆菌标准菌株（H37Rv）基因组模板序列比对后获得447株满足分析要求的全基因组测序菌株。每株菌株经单核苷酸多态性（SNP）鉴定后与H37Rv各基因型和亚型的特异性突变和对11种抗结核药品已知的耐药基因突变进行比对,获得各菌株独属的基因型或亚型和耐药基因突变,并分析不同药品耐药基因中的主要耐药突变类型不同基因型或亚型间的相关性。结果 447株MDR-MTB中全基因组测序结果显示,432株（96.6%）发生基因突变,MTB对11种药品主要的耐药突变类型分别为katG-315-S/T[INH,81.7%（353/432）]、rpoB-450-S/L[RFP,59.7%（258/432）]、rpsL-43-K/R[Sm,66.0%（198/300）]、embB-306-M/V[EMB,35.5%（94/265）]、pncA... 

【文章来源】：中国防痨杂志. 2020,42(06)CSCD

【文章页数】：7 页

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3179078