基于iTRAQ的蛋白组学技术筛查泡球蚴病患者血清特异性标志物的初步研究

发布时间：2021-05-11 23:09

　　目的:应用i TRAQ标记联合LC-MS/MS技术筛查AE患者血清中的差异表达蛋白,初步筛选AE血清早期诊断的特异性标志物。方法:1.收集2016年1月-2016年5月期间在青海大学附属医院肝胆胰外科住院经彩超、CT、MRI或手术后病理确诊的HAE患者血清3例及伴随肝外转移AE患者血清3例,同时收集健康体检者血清2例作为对照。2.将收集的血清8例经去血清高丰度蛋白、电泳及酶解后采用iTRAQ 8-plex标记技术进行标记（其中健康体检者A组标记“113、114”,HAE患者B组标记“115、116、117”,伴随肝外转移AE患者C组标记“118、119、121”）。3.使用高分辨质谱仪Q Exactive（Thermo Scientific）行质谱分析,用软件Mascot2.5和Proteome Discoverer2.1蛋白质鉴定软件对UniProt蛋白质数据库进行搜索,以报告基团“113、114”的相对含量作为参照对象,选择差异具有显著的的结果（p<0.05）,高于1.2或低于0.83的倍数变化被认为显著上调或下调,并应用GO分类、KEGG通路等数据库平台对差异表达蛋白进行生... 

【文章来源】：青海大学青海省 211工程院校

【文章页数】：43 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
主要符号对照表
第1章 引言
第2章 材料与方法
    2.1 研究对象及分组
        2.1.1 研究对象
        2.1.2 分组
    2.2 试剂与仪器
        2.2.1 实验仪器和分析软件
            2.2.1.1 主要实验仪器
            2.2.1.2 分析软件
        2.2.2 试剂和耗材
    2.3 实验方法
        2.3.1 血液标本的采集与保存
        2.3.2 去除血清高丰度蛋白及SDS-PAGE电泳
        2.3.3 FASP酶解
        2.3.4 iTRAQ标记
        2.3.5 HighPHRP分级
        2.3.6 质谱分析
        2.3.7 数据库检索及生物信息学分析
    2.4 统计学方法
    2.5 技术路线
第3章 结果
    3.1 研究对象的一般资料
    3.2 研究结果
        3.2.1 外周血清蛋白鉴定和定量结果评估
        3.2.2 蛋白质定性结果展示
        3.2.3 蛋白质定量结果展示
        3.2.4 外周血差异蛋白鉴定结果
        3.2.5 生物信息分析—GO功能注释及GO功能富集分析
        3.2.6 生物信息分析—KEGG通路注释及KEGG通路富集分析
        3.2.7 生物信息分析—蛋白质聚类分析
        3.2.8 差异蛋白筛选结果
第4章 讨论
第5章 结论
参考文献
致谢
附录A 综述
    参考文献
作者简介


【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]泛素结合酶UBE2T在鼻咽癌发生发展中的作用及其机制探讨[D]. 胡威.南方医科大学 2016



本文编号：3182276