基于全基因组测序的结核病传播及耐药特征分析

发布时间：2021-05-20 01:16

　　第一部分基于全基因组测序的西藏结核病传播特征分析目的利用全基因组测序技术分析西藏地区结核病近期传播及其相关影响因素和跨区传播情况,为当地相关部门制定防治管理措施提供参考依据。方法收集西藏2006、2009和2010年的结核分枝杆菌菌株576株,通过流行病学调查获取每株菌株的社会人口学信息、临床特征等信息。利用全基因组测序技术回顾性分析西藏的结核病的传播情况,并分析影响西藏结核病传播的相关因素、跨区传播的情况。结果（1）以5个和12个SNP为界,在540株MTB中分别鉴定到196株（36.3%）和308株（57.0%）成簇菌株。（2）单因素分析结果显示2010年、痰涂片（+）、北京基因型、RR/MDR均为成簇的影响因子（P值均<0.05）;多因素分析结果提示无论以SNP≤5还是SNP≤12定义成簇时,2010年（OR5=2.72,95%CI:1.70-4.48;OR12=1.88,95%CI:1.22-2.97）、北京基因型（ORSNP≤5=3.77,95%CI:1.72-9.49;OR SNP≤12=4.91,95%CI:2.48-10.47）、RR/MDR（OR SNP≤5=2... 

【文章来源】：南华大学湖南省

【文章页数】：95 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略词
第一部分 基于全基因组测序的西藏结核病传播特征分析
    1.1 前言
    1.2 对象和方法
    1.3 结果
        1.3.1 西藏结核分枝杆菌菌株的基本信息
        1.3.2 西藏成簇菌株影响因素分析
        1.3.3 西藏结核病跨区传播情况
        1.3.4 西藏结核病传播簇大小与初复治的相关性
    1.4 讨论
    1.5 小结
第二部分 基于全基因组测序的中国耐多药结核分枝杆菌耐药突变特征分析
    2.1 前言
    2.2 对象和方法
    2.3 结果
        2.3.1 结核分枝杆菌中MDR菌株分布情况
        2.3.2 MDR菌株耐药特点
        2.3.3 GenoType MTBDRplus和 MTBDRsI检测效果评价
        2.3.4 遗传背景与耐药突变的相关性分析
    2.4 讨论
    2.5 小结
结论
参考文献
综述
    参考文献
攻读硕士学位期间发表的科研成果
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]荧光PCR探针熔解曲线技术检测结核分枝杆菌对五种抗结核药物耐药性的研究[J]. 曹志华,赵悦竹,胡双双.  中国防痨杂志. 2019 (02)
[2]2010年西藏自治区结核病监测资料分析[J]. 平措卓玛.  疾病监测. 2013(04)
[3]2010年全国第五次结核病流行病学抽样调查报告[J]. 王黎霞,成诗明,陈明亭,赵雁林,张慧,姜世闻,何广学,吕青,杜昕,陈伟,刘小秋,阮云洲,王胜芬,夏愔愔,于兰,李峻,李雪.  中国防痨杂志. 2012(08)
[4]西藏自治区复治涂阳肺结核病人发生原因分析[J]. 国杰.  中国防痨杂志. 2008(06)
[5]MLVA和Spoligotyping用于西藏地区216株结核分枝杆菌临床分离株的基因分型研究[J]. 石荔,杨敏,Christine Pourcel,董海燕,尼玛彭多,张嫒媛,朗珍,吕冰,蒋毅,魏淑贞,范昕建,万康林.  中华微生物学和免疫学杂志. 2007(08)



本文编号：3196795