上海市金山区2015—2019年流感病原学监测结果分析

发布时间：2021-06-13 01:57

　　目的了解金山区2015—2019监测年度流行性感冒（流感）的病原学特征,为流感防控提供科学依据。方法收集金山区2015—2019监测年度流感样病例的鼻咽拭子标本,通过Real-time RT-PCR鉴定流感病毒亚型,核酸阳性标本用马丁达比犬肾（Madin-Darby canine kidney, MDCK）细胞和（或）无特定病原体（specific pathogen free, SPF）鸡胚分离培养,对甲型流感进行HA基因分析。结果 2015—2019监测年度共采集流感样病例鼻咽拭标本4 263份,流感病毒核酸检测总阳性率为23.95%（1 021/4 263）。其中甲型流感病毒检出阳性数占检测总阳性数的80.99%,主要为甲型H3N2和甲型H1N1。流感病毒检出阳性率及分型情况呈季节分布,各年龄组核酸检测阳性率差异有统计学意义（χ²=83.783,P<0.05）,其中60岁以上组阳性率最高30.77%,0～岁组阳性率最低12.10%,不同性别间流感病毒核酸检测阳性率差异无统计学意义（χ²=3.740,P>0.05）。基因进化分析... 

【文章来源】：实用预防医学. 2020,27(11)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

2015—2019年金山区流感病毒亚型总体分布特征

甲型H1N1流感病毒疫苗参考株A/Michigan/45/2015 (H1N1)pdm09 (GenBank:MK622940)的HA基因编码区核苷酸长度为1 753 bp,选取的20株甲型H1N1流感毒株HA基因序列经测定均为996 bp,对应参考序列为137～1 132 bp,将20株甲型H1N1流感病毒毒株HA基因序列与当年的疫苗株及其它代表株进行遗传进化树分析。结果表明,人群与野禽、猪流行的甲型H1N1流感毒株HA基因不在一个分支上,进化树共分为Homo sapiens和Out Group两个群组,2009年以后上海及周边地区流行的甲型H1N1流感代表株HA基因和1996—1997年上海地区代表株不在同一分支上,20株甲型H1N1流感病毒毒株HA基因与流感病毒疫苗参考株基因亲缘较近,而与2009—2013年上海及周边地区流行的甲型H1N1流感毒株HA基因不在同一分支上,见图2。2.2.2 甲型H3N2流感病毒HA基因进化树分析

甲型H3N2流感病毒疫苗参考株A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016(H3N2)(GISAID)的HA基因编码区核苷酸长度为1 737 bp,选取的7株甲型H3N2流感毒株HA基因序列经测定均为1 055 bp,对应参考序列为18～1 072 bp,将7株甲型H3N2流感病毒毒株HA基因序列与当年的疫苗株及其它代表株进行遗传进化树分析。结果表明,人群与2019年上海犬类流行的甲型H3N2流感毒株HA基因不在一个分支上,进化树共分为Homo sapiens和Out Group两个群组,2012年以后中国流行的甲型H3N2流感代表株HA基因和2010年杭州地区代表株不在同一分支上;7株甲型H3N2流感病毒毒株HA基因与流感病毒疫苗参考株基因亲缘较近,而与2012—2014年中国流行的H3N2流感病毒毒株HA基因不在同一分支上,见图3。3 讨 论

【参考文献】：
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本文编号：3226753