获得性免疫缺陷综合征患者易感抑郁症差异表达基因的生物信息学分析

发布时间：2021-06-17 07:48

　　目的探索获得性免疫缺陷综合征（AIDS）患者易感抑郁症的关键差异表达基因,为进一步研究寻找靶点。方法通过GEO数据库下载AIDS合并抑郁症患者和AIDS患者额叶皮层灰质细胞的基因芯片数据集GSE17440,利用R语言挖掘差异表达基因,通过STRING、metascape等工具进行生物信息学分析。结果挖掘出差异表达基因71个,其中上调基因16个,下调基因55个。经过不同的富集工具富集,差异表达基因主要集中于细胞凋亡通路。构建蛋白与蛋白互相作用的网络图显示,差异表达基因的表达产物大部分存在密切的相互作用,AIDS合并抑郁症患者脑部组织免疫防御反应异常激活。结论通过对AIDS合并抑郁症患者和AIDS患者差异表达基因的分析,对其差异基因有了系统的认识,针对关键基因的大样本研究及网络化基因分析是未来的研究方向。 

【文章来源】：重庆医学. 2020,49(13)

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

AIDS合并抑郁症患者及AIDS患者的差异基因聚类热图

通过在线软件metascape(http：//metascape.org/）对AIDS合并抑郁症患者及AIDS患者的差异基因进行富集，其富集结果见表3，其富集分类热图见图2。图3 AIDS合并抑郁症患者及AIDS患者的差异基因表达产物的相互作用网络图

AIDS合并抑郁症患者及AIDS患者的差异基因表达产物的相互作用网络图

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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本文编号：3234793