华支睾吸虫钙调蛋白基因的功能预测及其在华支睾吸虫成虫活动和囊蚴脱囊中的作用探讨
发布时间：2021-06-26 06:55
目的采用生物信息学方法分析预测华支睾吸虫钙调蛋白（CsCaM）基因的结构和功能,通过体内实验观察其对华支睾吸虫成虫活动能力和囊蚴脱囊的影响。方法利用生物信息学方法对华支睾吸虫钙调蛋白基因及其对应蛋白质的理化性质和空间构象进行预测,并通过对其他CaM序列进行同源性比对,分析该基因的进化规律。用CaM抑制剂三氟拉嗪（TFP）与华支睾吸虫成虫、囊蚴分别孵育,观察成虫活动能力以及囊蚴脱囊情况。结果 CsCaM基因编码区在第93-543 bp,编码149个氨基酸。编码蛋白的等电点为4.14,理论相对分子质量为16.8×103。拓扑结构分析该蛋白无信号肽和跨膜区。InterProScan预测CsCaM含2个超家族,4个EF手性结构域（1个超家族含有2个EF结构域）,分别位于aa21-aa33,aa57-aa69,aa94-aa106和aa130-aa142。CsCaM与其他物种CaM的同源性均在90%以上。TFP与华支睾吸虫成虫和囊蚴共孵育后,实验组成虫活动能力和囊蚴脱囊率均较对照组有所下降。结论 CsCaM具有钙离子信号蛋白的特性,参与华支睾吸虫成虫活动和囊蚴脱囊,是华支睾...
【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2020,15(10)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
华支睾吸虫CaM全长cDNA序列及其ORF编码的氨基酸序列
InterProScan分析CsCaM的氨基酸序列含有2个超家族,4个EF手性结构域(1个超家族含有2个EF结构域),分别位于aa21-aa33、aa57-aa69、aa94-aa106和aa130-aa142(图 2)。5 CsCaM的空间结构和亲水性特征
Sec(secondary structure)软件分析CsCaM蛋白的二级结构,α螺旋(H)、β折叠(E)及无规卷曲(L)分别占59.06%、0和40.94%。预测每个氨基酸的溶剂可及性(solvent accessibility, Acc),超过16%的表面暴露的定义为暴露氨基酸(e),其余为包埋氨基酸(b)。从分析结果看,69.13%的氨基酸残基暴露在溶液界面,其余30.87%氨基酸残基包埋在蛋白质内部。Htm预测该蛋白无跨膜区(图 3)。6 CsCaM的三维结构[9]
【参考文献】：
期刊论文
[1]华支睾吸虫感染与胆管癌发病关系的研究进展[J]. 冯铭彬,刘超. 中华肝脏外科手术学电子杂志. 2017(06)
[2]华支睾吸虫生活史在实验室的建立[J]. 梁炽,胡旭初,吕志跃,吴忠道,余新炳,徐劲,郑焕钦. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2009(02)
[3]血吸虫钙调蛋白与吡喹酮杀虫作用机理[J]. 潘星清,郭菁. 中国寄生虫病防治杂志. 1990(01)
本文编号：3250860
【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2020,15(10)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
华支睾吸虫CaM全长cDNA序列及其ORF编码的氨基酸序列
InterProScan分析CsCaM的氨基酸序列含有2个超家族,4个EF手性结构域(1个超家族含有2个EF结构域),分别位于aa21-aa33、aa57-aa69、aa94-aa106和aa130-aa142(图 2)。5 CsCaM的空间结构和亲水性特征
Sec(secondary structure)软件分析CsCaM蛋白的二级结构,α螺旋(H)、β折叠(E)及无规卷曲(L)分别占59.06%、0和40.94%。预测每个氨基酸的溶剂可及性(solvent accessibility, Acc),超过16%的表面暴露的定义为暴露氨基酸(e),其余为包埋氨基酸(b)。从分析结果看,69.13%的氨基酸残基暴露在溶液界面,其余30.87%氨基酸残基包埋在蛋白质内部。Htm预测该蛋白无跨膜区(图 3)。6 CsCaM的三维结构[9]
【参考文献】：
期刊论文
[1]华支睾吸虫感染与胆管癌发病关系的研究进展[J]. 冯铭彬,刘超. 中华肝脏外科手术学电子杂志. 2017(06)
[2]华支睾吸虫生活史在实验室的建立[J]. 梁炽,胡旭初,吕志跃,吴忠道,余新炳,徐劲,郑焕钦. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2009(02)
[3]血吸虫钙调蛋白与吡喹酮杀虫作用机理[J]. 潘星清,郭菁. 中国寄生虫病防治杂志. 1990(01)
本文编号：3250860
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/chuanranbingxuelunwen/3250860.html
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