广东省江门市HIV-1亚型及流行毒株gag基因特征分析

发布时间：2021-07-31 14:29

　　目的了解广东省江门市1型艾滋病病毒（HIV-1）基因亚型分布状况及其主要流行株CRF01_AE的传播和基因变异特征。方法收集江门市2018-2019年新确证为HIV-1感染且未经抗病毒治疗的208例样本,采用巢式荧光定量聚合酶链反应法（PCR）扩增gag基因序列并测序,应用Genotyping Tool进行基因分型、PhyML3.0软件构建系统进化树,利用Entropy和VESPA程序对CRF01_AE毒株亚簇进行氨基酸序列特征分析。结果成功测得gag序列173条,异性性传播占72.83%（126条）,同性性传播占17.92%（31条）;亚型分析结果显示,CRF01_AE 69例（39.88%）,CRF07_BC 57例（32.95%）,19例（10.98%）CRF55₀1B,12例（6.94%）B亚型,其他亚型包括CRF08_BC、CRF59₀1B、C亚型和URFs共16例（9.25%）。CRF01_AE在系统进化树上形成... 

【文章来源】：中国艾滋病性病. 2020,26(09)北大核心CSCD

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【部分图文】：

CRF01＿AE毒株两个主要传播簇氨基酸多态性分析


本文编号：3313637