上海市浦东新区2014—2015年HIV-1感染者治疗前基因特性及耐药分析

发布时间：2021-08-08 07:59

　　目的了解上海市浦东新区2014—2015年进入治疗的HIV-1感染者的基因特性及耐药情况。方法以巢式RT-PCR方法扩增91份治疗前HIV-1感染者样品HIV-1聚合酶片段,测序,构建进化树并进行HIV-1基因亚型分析,将获得的核酸序列提交至斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药位点分析。结果 91份样品测序成功53份,其中CRF01_AE重组体占67.9%（36/53）,B亚型占7.5%（4/53）,C亚型占3.8%（2/53）,CRF07_BC重组体占20.8%（11/53）。在53条基因序列中41条检测到与HIV-1蛋白酶抑制剂（PIs）和逆转录酶抑制剂（RTIs）相关的共计66个突变位点,其中4个耐药突变位点与非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）及核苷类逆转录酶抑制剂（NRTIs）耐药相关,原发耐药率为7.5%（4/53）;37条基因序列检测到的62个突变位点与HIV-1 PIs和RTIs继发耐药性突变或基因的多形态改变相关。结论 2014—2015年进入治疗的HIV-1感染者基因多种亚型并存,以CRF01_AE重组体为... 

【文章来源】：上海预防医学. 2016,28(12)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 对象与方法
    1.1 对象
    1.2 方法
        1.2.1 样品采集及处理
        1.2.2 HIV-1核酸提取
        1.2.3 HIV-1蛋白酶区、逆转录酶区的扩增及测序
        1.2.4 亚型及耐药位点分析
    1.3 统计学分析
2 结果
    2.1 基本流行病学特征
    2.2 进化树构建和亚型分析
    2.3 HIV-1蛋白酶和逆转录酶区相关突变位点分析
    2.4 HIV-1蛋白酶抑制剂(PIs)和逆转录酶抑制剂(RTIs)耐药相关基因突变分析
        2.4.1 PIs耐药相关基因突变分析
        2.4.2 RTIs耐药相关基因突变分析
    2.5 HIV-1基因亚型与耐药突变位点的关系
    2.6 HIV-1基因亚型与耐药的关系
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]吉林省HIV-1耐药警戒线调查分析[J]. 臧希卉,燕晶,郭琪,孙柳燕,邢辉.  中国卫生工程学. 2015(06)
[2]上海市常住人口HIV-1感染者基因亚型和耐药性突变横断面研究[J]. 薛以乐,宫菊丽,郑晓虹,盖晶,张玮,宁镇,庄鸣华,潘启超,卢伟,钟平,康来仪.  诊断学理论与实践. 2007(03)



本文编号：3329559