中国西部地区1b型慢性丙型肝炎患者直接抗病毒药物（DAAs）预存耐药相关替代的流行情况分析

发布时间：2021-10-21 16:42

　　背景:直接抗病毒药物（DAAs）作用于丙型肝炎病毒（HCV）的疗效是很好的。然而,针对DAAs的RASs的出现会影响其抗病毒治疗的有效性,尤其是基线RASs的存在。此外,中国西部地区1b型慢性丙型肝炎患者DAAs预存RASs的流行情况仍不清楚。材料与方法:本研究纳入70例中国西部地区基因1b型慢性丙型肝炎初治患者进行分析,PCR分别扩增HCV NS3、NS5A和NS5B基因,并直接测序。序列通过MEGA5.0软件进行比对分析,各区RASs的进化模式和氨基酸共变模型分别通过MEGA v5.05软件和Cytoscape v3.2.1软件构建。结果:HCV NS3区总的RASs流行率是很高的（85.48%;53/62）,RASs主要包括C16S,T54S,Q80R/L,A87T,R117H,S122G,V132I,V170I;其次是NS5A区42.42%（28/66）,RASs主要存在于L28M,R30Q,Q54H,P58S/T,Q62H/R,Y93H位点;值得注意的是,在HCV NS5B区,我们发现100%（44/44）的患者均出现了至少一个RASs,这些突变位点主要包括N142S,A30... 

【文章来源】：重庆医科大学重庆市

【文章页数】：49 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

Sanger测序典型的峰图

图 2. 不同作用区段 DAAs 临床耐药相关替代（RASs）的流行情况。Figure 2. The prevalence of clinically relevant resistance associated substitutions (RASs) invarious regions and DAA classes. Frequency of clinically relevant RASs for NS3 regions (A),NS5A region (B) and NS5B region(C). And total frequency of clinically relevant RASs fordifferent DAA classes (D).另外，62 例患者中有 25 例（40.32％）携带多种 NS3 RASs。具体来说，18例（29.03％）患者携带两种不同的 RASs，如 V170I+S122G 和 T54S+S122G;5例（8.06％）患者携带三种不同的 RASs，如 Q80R + T54S + S122G 和 Q80R +S122G + V170I。重要的是，还在两名患者中分别检测到四种不同的 RAS 如：Q80R + T54S + V170I + S122G 和 C16S + R117H + V170I + S122G。3.3 NS5A 蛋白抑制剂的 RASs 的流行情况

重庆医科大学硕士研究生学位论文区段联合 RAS 频率最高的是 NS3 + NS5B 区域，其次是 NS5A + NS5NS5B 和 NS3 + NS5A + NS5B 区域。因为在所有 NS5B 序列中均观察到替代，这可能导致包含 NS5B 区的联合突变流行率较高。因此，我们16N 后再次分析了各个区段联合突变的结果，观察到类似但较低的流行结果展示在图 3 中。

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3449359