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云南省静脉注射吸毒人群中HCV感染的分子流行病学研究

发布时间:2021-10-22 06:00
  丙型肝炎(Hepatitis C)是威胁人类身体健康的重要传染病,其病原体是丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus, HCV),全球范围内大约有1.7亿人感染了HCV,我国的感染率约为3.2%。HCV感染容易慢性化,慢性丙型肝炎约有20%-30%会在20年内缓慢进展为肝硬化和肝癌,HCV感染成为导致肝癌及终末期肝病的重要原因。HCV的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)缺乏校对功能,使得RNA在复制过程中错配率极高,最终导致了HCV基因组中核苷酸突变频率极高,为基因分型提供了基础。HCV可分为6个主要基因型,每个基因型又可分为若干亚型,HCV基因型的不同直接影响HCV的致病力和患者对药物治疗的反应性。在静脉注射吸毒人群中HCV的感染比例极高(15.6%-98.7%),云南省地处中国西南边陲,与缅甸、老挝、越南三国接壤,紧邻世界最大的鸦片种植地“金三角”,是毒品运输入中国内地的重要节点,具有大量的吸毒人员。相关调查显示云南省静脉注射吸毒人群HCV的感染率接近80%。本研究从昆明市疾病预防控制中心获得了100份2012年1月至5月期间收集于云南不同地区吸毒人员的HCV阳性血清样本... 

【文章来源】:北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】:86 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
Abstract
1. 引言
    1.1 HCV的基因组结构及编码产物
        1.1.1 HCV的基因组结构
        1.1.2 病毒蛋白的结构与功能
    1.2 HCV的传播途径
        1.2.1 血液传播
        1.2.2 性传播
        1.2.3 垂直传播
    1.3 HCV基因分型
        1.3.1 HCV的基因分型系统
        1.3.2 全球HCV的流行与进化
        1.3.3 我国静脉注射吸毒人群中HCV的流行与进化
        1.3.4 HCV基因分型的意义
        1.3.5 HCV基因分型的方法
2. 研究目的及意义
3. 材料和方法
    3.1 血清样品
    3.2 主要试剂及材料
    3.3 主要仪器设备
    3.4 软件
    3.5 引物设计及主要参考序列
4. 实验方法
    4.1 病毒基因组RNA的提取
    4.2 逆转录反应获取HCV cDNA
    4.3 分型区段的选择及PCR反应条件摸索
    4.4 PCR扩增HCV C/E1区的部分序列
    4.5 琼脂糖凝胶电泳
    4.6 PCR产物的纯化
    4.7 受体菌DH5a的感受态制备
    4.8 纯化产物于PMD19-T载体的连接
    4.9 转化感受态细胞DH5a
    4.10 阳性重组质粒的提取及鉴定
    4.11 数据分析
5. 实验结果
    5.1 HCV分型扩增区段地选择及PCR条件优化
    5.2 阳性样本中HCV RNA的PCR检测
    5.3 HCV C/E1区段的PCR扩增
    5.4 PCR产物胶回收、测序用重组载体PMD19-T的构建与鉴定
    5.5 HCV阳性样本中HCVC/E1区段测序结果
    5.6 云南省静脉吸毒人群中HCV的基因型分布
    5.7 云南省静脉吸毒人群HCV感染亚型的性别及年龄分布
    5.8 云南省静脉吸毒人群中HCV的基因型分布状况与其他地区分布状况的对比
    5.9 云南省静脉吸毒人群中现有HCV的基因型分布状况与早期研究的对比
6. 讨论
7. 小结
参考文献
附录一 HCV阳性样品测序序列
附录二 主要缩略词表
附录三 主要溶液配制方法
致谢
研究生简历
攻读硕士期间发表论文的情况


【参考文献】:
期刊论文
[1]丙型肝炎病毒基因分型的研究进展[J]. 张瑞,杜绍财.  中华检验医学杂志. 2006(05)
[2]丙型肝炎病毒传播研究新进展[J]. 郭振华,景涛.  临床消化病杂志. 2005(02)
[3]不同感染途径慢性丙型肝炎患者HCV基因型分布的差异[J]. 谢尧,赵辉,鸥蔚妮,闫杰,杜邵财,徐道振.  中华实验和临床病毒学杂志. 2004(03)
[4]中国丙型肝炎病毒基因型研究新进展[J]. 张瑞,杜绍财,邱国华,刘峰,魏来.  中国生物工程杂志. 2004(09)
[5]建立DNA芯片技术检测丙型肝炎病毒基因型及其初步应用[J]. 毛红菊,顾士民,赵建龙,刘江霞.  中华实验和临床病毒学杂志. 2003(04)
[6]丙型病毒性肝炎与性传播关系的临床研究[J]. 王晓铃,解松刚,杨伟霞.  实用临床医药杂志. 2003(01)
[7]108例抗-HCV阳性病人流行病学追溯性调查[J]. 赵和平,张玲荣,邓春青,郭慧安.  中华流行病学杂志. 1997(05)
[8]丙型肝炎病毒传播途径的研究进展[J]. 徐杰.  国外医学(流行病学传染病学分册). 1995(06)



本文编号:3450518

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