广西三城市HIV-1型流行毒株gag基因亚型分析

发布时间：2017-05-09 20:12

  本文关键词：广西三城市HIV-1型流行毒株gag基因亚型分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的了解广西2008年及以后确诊的HIV-1感染者流行病学及HIV-1亚型分布情况,从而进一步掌握广西最近的HIV-1流行毒株的分布规律、感染来源,并大体推测出其流行和蔓延规律,为广西艾滋病的预防控制策略的制定提供依据,甚至为全国的艾滋病预防控制工作的开展提供有价值的参考资料。方法分别在桂林、来宾、钦州采取样本100例、102例和103例,所有研究对象都经WB实验确认为HIV-1感染者。对研究对象进行问卷调查、收集流行病学资料,包括病人基本信息(年龄、性别、职业、文化程度等)、有可能的感染途径、确诊时间、最近一次的病毒载量等;采集抗凝全血10mL、提取病毒RNA、用RT-PCR进行gag基因扩增并将阳性扩增产物送北京博迈德公司进行Sanger法测序,然后采用Bioedit、Simplot和MEGA 5.05等相关生物学软件对所得序列进行序列的比对校正、亚型分析和系统进化分析。结果1.研究对象共305人,流行病学特征统计如下:⑴男性多于女性,男性患者占66.56%(203/305),女性患者占33.44%(102/305),男女比例为1.99:1(203/102);⑵20~49岁年龄组患者占56.72%(173/305),≥50岁年龄组患者的构成比达到44.62%(130/305);⑶农民所占比例最大,超过了一半,为50.82%(155/305),其次为家务及待业人员13.77%(42/305)、工人及民工12.13%(37/305),学生和离退休人分别占到了2.3%(7/305)和5.57%(17/305);⑷初中及以下学历人数的构成比为76.39%(233/305),大专及以上学历人数占到了4.92%(15/305);⑸异性性接触传播占绝大部分为95.74%(292/305),同性性传播、注射毒品传播所占比例较小;⑹已婚人数占67.87%(207/305);未婚、离异或丧偶分别占16.72%(51/305)和14.75%(45/305)。2.扩增与测序概况:共305份血浆样本,成功扩增gag区175例;测序成功得到基因序列155份。3.亚型判定及分布⑴最终成功扩增得到155份样本的gag基因序列,共发现4种亚型:CRF01-AE亚型124例,CRF07-BC亚型12例,CRF08-BC亚型14例,B亚型5例。⑵各地区均以CRF01_AE为主,5例B亚型均分布在桂林地区,CRF07-BC亚型、CRF08-BC亚型在各地区均有分布。结论1.根据流行病学资料结果,我们可以得出以下结论:应重视女性性病的治疗、更加重视婚检、孕检的艾滋病抗体筛查,关注老年人、学生经性接触感染艾滋病的现象,加大对已婚患者的监管力度,采取针对低文化水平人群的有效防治措施。2.通过对广西三城市HIV-1流行毒株gag区的扩增测序结果,我们发现了4种亚型:CRF01-AE亚型124例,CRF07-BC亚型12例,CRF08-BC亚型14例,B亚型5例,提示广西地区HIV-1流行毒株存在亚型多样性。3.广西各地区以异性性接触传播为主要传播途径,主要流行亚型为CRF01_AE,可能来自于国内毒株。随着主要传播途径和亚型的变化,迫切需要对高危人群进行宣传教育和行为干预以阻断HIV/AIDS的流行和传播。4.从分子水平上证实了广西地区的HIV-1流行毒株亚型和感染途径存在多样性。
【关键词】：HIV-1 流行特征 亚型 gag基因
【学位授予单位】：桂林医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R512.91
【目录】：

• 中文摘要5-7
• ABSTRACT7-10
• 英汉缩略词对照表10-11
• 前言11-16
• 1 实验材料16-19
• 1.1 研究对象16
• 1.2 主要实验仪器16-17
• 1.3 主要实验试剂17-18
• 1.4 主要耗材18
• 1.5 相关软件18-19
• 2 实验方法19-23
• 2.1 提取血浆病毒RNA19-20
• 2.2 逆转录/巢式PCR（RT/Nest-PCR）20-22
• 2.3 序列分析22-23
• 3 结果23-27
• 3.1 gag区电泳图23
• 3.2 流行病学调查结果23-24
• 3.3 基因分型结果24-27
• 4 结论27-29
• 参考文献29-33
• 综述33-42
• 参考文献39-42
• 攻读学位期间发表的学术论文目录42-43
• 致谢43-44

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