云南省鼠疫耶尔森菌多位点可变数目串联重复序列和差异片段的基因分型及其流行病学意义

发布时间：2021-12-29 23:29

　　[目的]利用MLVA和DFR基因分型技术对云南省分离的鼠疫菌株进行基因分型，探究云南各型鼠疫菌菌株之间的内在联系、遗传特征、流行特征及疫源地之间的联系，为云南省鼠疫的防控工作提供依据。[材料与方法]MLVA分型：1.菌株选择选择分离自不同地点、不同年代、不同来源的云南鼠疫菌株158株，其中家鼠鼠疫菌株135株、野鼠鼠疫菌株16株、丽江玉龙菌株7株，另外还有1株EV菌。2. VNTR位点选择VNTR位点是根据已公布的13株鼠疫菌全基因比对，筛选了14个VNTR位点，其中12个位点是全新的位点，另两个是已公布使用过的位点。3. DNA的提取利用QIAGEN细菌DNA提取试剂盒进行提取制备。4. PCR扩增和毛细管电泳采用25l的多重PCR反应体系进行扩增，将产物进行毛细管电泳分析，通过PCR产物大小计算出重复数，最后结果以Excel形式保存。5.结果分析通过BioNumerics软件进行数据处理，得到各位点的分辨指数，绘制聚类图和最小生成树。DFR分型：1.菌株选择选择分离自不同地点、不同年代、不同来源的云南鼠疫菌株171株，其中家鼠鼠疫菌株148株、野鼠鼠疫菌株16株、丽江玉龙菌株7株。... 

【文章来源】：大理大学云南省

【文章页数】：41 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
缩略语表
摘要
Abstract
前言
    1、中国鼠疫流行概述
    2、云南鼠疫流行概述
    3、鼠疫菌分型及基因组多态性研究进展
    4、本研究内容和意义
基于串联重复序列的云南省鼠疫菌基因多态性研究
    1、导论
    2、材料与方法
    3、结果
    4、讨论
基于差异片段云南省鼠疫菌基因组多态性研究
    1、导论
    2、材料与方法
    3、结果
    4、讨论
总结
参考文献
附录
综述
    参考文献
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]鼠疫疫苗株脉冲场凝胶电泳操作规范的建立[J]. 石丽媛,王鹏,叶蕊,张蓉.  中国地方病防治杂志. 2012(03)
[2]1999～2008年云南省重要自然疫源性疾病疫情分析[J]. 栾玉泉,杨春光,张再兴,董兴齐.  中国血吸虫病防治杂志. 2009(04)
[3]云南省玉龙县鼠疫菌的生化特性[J]. 郭英,张丽云,夏连续,张志凯,蔡虹,马凤琴,张建华,海荣,宋志忠.  地方病通报. 2008(03)
[4]云南玉龙及古城区鼠疫自然疫源地判定及初步研究[J]. 宋志忠,夏连续,梁云,郭英,鲁亮,王国良,蔡文凤,张正飞,和映天,张福新,董兴齐,于国林,王健,俞东征.  中国地方病防治杂志. 2008(01)
[5]鼠疫耶尔森氏菌基因分型的研究进展[J]. 周树武,杨进业.  中国热带医学. 2007(03)
[6]云南省鼠疫菌株脉冲场电泳分析[J]. 王鹏,石丽媛,董兴齐,于国林.  医学动物防制. 2006(05)
[7]应用抑制削减杂交技术进行鼠疫耶尔森菌的比较基因组研究[J]. 戴二黑,童宗中,王效义,周冬生,张建国,李蓓,杨俊兴,陈泽良,宋亚军,郭兆彪,王津,杨瑞馥.  中华微生物学和免疫学杂志. 2005(03)
[8]中国鼠疫耶尔森菌的分子生物学特征与遗传学意义[J]. 海荣,俞东征,魏建春,夏连续,史献明,张志凯,张恩民.  中华流行病学杂志. 2004(06)
[9]鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究[J]. 周冬生,韩延平,宋亚军,童宗中,裴德翠,戴二黑,张玲,包静月,李敏,崔百忠,张秀清,王津,郭兆彪,祁芝珍,金丽霞,翟俊辉,杜宗敏,王效义,汪建,黄培堂,杨瑞馥.  解放军医学杂志. 2004(03)
[10]串联重复序列及其在鼠疫菌基因分型中的应用[J]. 付秀萍,俞东征,海荣.  中华流行病学杂志. 2004(03)

博士论文
[1]鼠疫耶尔森氏菌基因组多态性研究及快速鉴定溯源系统的建立[D]. 李艳君.中国人民解放军军事医学科学院 2009

硕士论文
[1]中国鼠疫耶尔森菌多位点可变数目串联重复序列分析[D]. 张晓媛.中国疾病预防控制中心 2008



本文编号：3557043