高通量二代测序技术在耐药结核病诊断中的应用

发布时间：2022-01-06 14:10

　　目的探索新一代高通量二代测序（next-generation sequencing,NGS）技术在耐药结核病诊断中的应用价值。方法搜集2016—2017年甘肃省结核病耐药基线调查150株临床分离株,排除非结核分枝杆菌（non-tuberculous mycobacteria,NTM）菌株2株,进行比例法药物敏感性试验（简称"药敏试验"）及结核分枝杆菌耐药相关基因（包括katG、inhA、embB、rpoB、rpsL、rrs、gyrA和gyrB）的NGS技术检测,剔除测序失败的13株,最后纳入分析菌株135株。以比例法药敏试验结果为参考标准评价二代测序在耐药结核病中的检测效能。结果以药敏试验结果为参考标准,NGS技术检测异烟肼、乙胺丁醇、利福平、链霉素、氧氟沙星耐药的敏感度分别为:88.75%（71/80）、85.71%（18/21）、84.72%（61/72）、73.91%（51/69）、68.97%（20/29）,特异度分别为100.00%（55/55）、86.84%（99/114）、96.83%（61/63）、96.97%（64/66）、99.06%（105/106）,Kappa值... 

【文章来源】：中国防痨杂志. 2020,42(11)CSCD

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
材料和方法
    一、材料收集
    二、研究方法
        1．药敏试验：
        2. DNA提取：
        3. NGS技术检测：
        4．结果分析：
    三、统计学处理
结果
    一、NGS对5种药物耐药性检测的效能
    二、结核分枝杆菌对5种药物耐药的相关基因突变类型及频率分析（表3)
        1．异烟肼：
        2．乙胺丁醇：
        3．利福平：
        4．链霉素：
        5．氧氟沙星：
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]新一代微测序基因芯片的设计及其耐药性检测效果的初步研究[J]. 孙照刚,张洪静,李自慧,孙琦,吕琳娜,潘丽萍,Sandy Gilbert,张宗德,许绍发,James Xia.  中国防痨杂志. 2019 (06)
[2]结核分枝杆菌耐药性检测专家共识[J]. Editorial Board of Chinese Journal of Antituberculosis;Basic and Clinical Groups of Tuberculosis Control Branch of China International Exchange and Promotive Association for Medical and Health Care;.  中国防痨杂志. 2019 (02)
[3]结核分枝杆菌耐药性检测方法的研究进展[J]. 张俊仙,吴雪琼.  中国防痨杂志. 2019 (02)
[4]二代测序技术对活动性结核病患者的诊断价值[J]. 周晛,艾静文,崔鹏,阮巧玲,沈瑶杰,王森,李永军,张文宏.  中国防痨杂志. 2018 (02)
[5]贵阳市结核分枝杆菌链霉素和乙胺丁醇耐药相关基因突变的检测与分析[J]. 孙荣,欧维正,王燕,蒙俊,秦万,毕雅坤,陈峥宏.  中国人兽共患病学报. 2016(08)
[6]耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析[J]. 陈燕,赵丽丽,孙庆,赵秀芹,吴移谋,万康林.  疾病监测. 2014(04)
[7]结核分枝杆菌耐药机制研究进展[J]. 闫雪梅,张朝霞.  新疆医科大学学报. 2012(02)
[8]应用基因芯片技术检测结核分枝杆菌链霉素耐药性的研究[J]. 张俊仙,吴雪琼,邢婉丽,梁艳,阳幼荣.  中国人兽共患病学报. 2009(11)



本文编号：3572600