调控miRNA成熟的相关基因SNPs与肺结核易感性的相关性研究

发布时间：2022-07-15 12:17

　　目的:信号通路上调控miRNA成熟的相关基因的SNPs可能通过影响基因的转录能力及蛋白质功能,干扰miRNA的成熟,调整miRNA的沉默作用,从而表现为疾病易感性的改变,即miRNA成熟通路上的SNPs与疾病相关。基于该理论及新疆维吾尔族肺结核的高发,本课题利用全外显子测序筛选新疆维吾尔族肺结核患者miRNA成熟通路上的易感基因,研究其基因多态性以及相应靶基因表达水平与维吾尔族肺结核的相关性,从而进一步推断miRNA对该疾病的致病性作用。方法:1)收集和田地区维吾尔族肺结核患者3例及对照组3例全血标本,利用二代测序技术进行全基因组外显子测序,初步筛选候选基因。查阅结核病发病机制的相关文献及利用生物信息学方法,从获得的突变基因上挑选信号通路上调控miRNA成熟的相关基因,最终确定候选基因;2)利用the International HapMap Project数据库（http://www.hapmap.org）、dbSNP数据库（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/）和miRBase registry数据库（http://microrna.s... 

【文章页数】：128 页

【学位级别】：博士

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中文摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 基于全外显子测序筛选新疆维吾尔族肺结核患者信号通路上与MIRNA成熟相关的易感基因
    1 研究内容与方法
        1.1 研究对象
        1.2 标本采集
        1.3 实验主要试剂
        1.4 实验主要仪器
        1.5 实验原理
        1.6 实验步骤
        1.7 数据分析
        1.8 数据的质量控制
        1.9 技术路线图
    2 结果
    3 讨论
    4 小结
第二部分 候选基因中的SNPS与新疆维吾尔族肺结核的易感性研究
    1 研究内容与方法
        1.1 研究对象
        1.2 标本采集
        1.3 主要试剂
        1.4 实验器材
        1.5 实验原理
        1.6 实验步骤
        1.7 统计学分析
        1.8 技术路线
    2 结果
    3 讨论
    4 小结
第三部分 基于EQTL分析进行SNPS阳性位点所在基因的表达与新疆维吾尔族肺结核的相关性研究
    1 研究内容与方法
        1.1 研究对象
        1.2 伦理审查
        1.3 血液样本收集
        1.4 ELISA实验
        1.5 qPCR检测
        1.6 技术路线
    2 结果
    3 讨论
    4 小结
结论
致谢
参考文献
综述
    参考文献
攻读博士学位期间获得的学术成果
个人简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]结核病及其易感基因的最近研究进展[J]. 杜敏,李钊伟,唐保明,李泽清.  中西医结合心血管病电子杂志. 2016(35)
[2]SLC11A1基因多态性与新疆喀什地区维吾尔族人群肺结核易感性的相关性研究[J]. 于潞,杨敏,吴江东,张萍,孟祥慧,张少杰,吴长新,陈创夫,曹旭东.  石河子大学学报(自然科学版). 2016(01)
[3]NRAMP1基因D543N多态现象与世居藏族结核病易感性的研究[J]. 央拉,次仁卓玛,钟铧,李长山,杜宝中.  西藏科技. 2015(04)
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[9]中国2004—2008年结核病死亡率特征分析及趋势[J]. 胡嘉,王黎霞,陈伟,黄飞,张慧,成诗明,周脉耕,王黎君.  中国防痨杂志. 2011(04)
[10]NRAMP1基因3′UTR多态现象与汉族结核病易感性的研究[J]. 段鸿飞,周新华,马玙,李传友,陈效友,高微微,郑素华.  中华结核和呼吸杂志. 2003(05)

博士论文
[1]MicroRNA相关单核苷酸多态性与原发性肝癌遗传易感性研究[D]. 李玉春.郑州大学 2012



本文编号：3662032