细粒棘球蚴线粒体nad1基因的克隆与序列分析
发布时间:2023-03-31 19:46
目的为完善细粒棘球蚴(Echinococcus granulasus)的分子分类学体系,提供更优化的种间和种内遗传标记基因。方法在内蒙古地区采集患羊肝脏细粒棘球蚴和肝包虫病患者棘球蚴。采用提取虫体DNA的方法,扩增线粒体NADH脱氢酶1(nad1)基因并进行测序,运用DNAstar5.0软件构建系统发育树并采用MEGA4.0软件进行自居检验。结果细粒棘球蚴DNA扩增出的羊株、人株nad1基因序列片段长度为895 bp。羊株、人株细粒棘球蚴nad1序列与加拿大棘球绦虫的同源性最高,相似性为86.5%;羊株、人株细粒棘球蚴nad1序列与加拿大棘球绦虫位于同一分支,自展值(Boostrap)最高,为100%。羊株、人株细粒棘球蚴nad1序列所属分支与裂头目、裂头科Diplogonoporus balaenopterae所属分支相隔最远。结论nad1基因有较高保守性,同时也存在种间差异,可广泛应用于研究细粒棘球绦虫的种间和种内遗传变异。
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验样品
1.1.2 菌种、载体及主要试剂
1.2 基因组DNA提取及PCR扩增
1.3 扩增片段的克隆与测序
1.4 序列分析
2 结 果
2.1 PCR扩增结果
2.2 克隆结果
2.3 测序结果细粒棘球蚴nad1序列
2.3.1 西乌旗羊株nad1序列
2.3.2 锡林浩特市人株细粒棘球蚴nad1序列
2.3.3 序列比对结果
2.3.4 基因序列同源性与遗传距离分析
3 讨 论
本文编号:3775684
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1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验样品
1.1.2 菌种、载体及主要试剂
1.2 基因组DNA提取及PCR扩增
1.3 扩增片段的克隆与测序
1.4 序列分析
2 结 果
2.1 PCR扩增结果
2.2 克隆结果
2.3 测序结果细粒棘球蚴nad1序列
2.3.1 西乌旗羊株nad1序列
2.3.2 锡林浩特市人株细粒棘球蚴nad1序列
2.3.3 序列比对结果
2.3.4 基因序列同源性与遗传距离分析
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