2018-2019年云南省昭通市A型流感病毒基因特征分析

发布时间：2023-05-04 03:25

　　目的分析2018-2019年云南省昭通市新甲型H1N1、H3N2亚型流感病毒流行情况及基因进化特征,为流感防控提供科学依据。方法收集2018年1月-2019年10月昭通地区哨点医院流感样病例咽拭子标本2 863份进行real-time RT–PCR检测,用狗肾传代细胞(Madin-Darby canine kidney cell,MDCK)对核酸阳性样本进行病毒分离,分离得到的流感毒株采用血凝抑制实验进行鉴定分型。最终选取43株新甲型H1N1亚型流感毒株,及15株H3N2亚型毒株进行全基因组测序,使用MEGA 5.2软件进行序列分析。结果系统发生分析表明95.35%(41/43)昭通新甲型H1N1分离株属于6B.1A支系, 93.33%(14/15)H3N2分离株属于3C.2a1b支系。与参考株A/California/07/2009相比,新甲H1N1分离株HA蛋白有7处抗原位点和1处受体结合位点发生变异,H3N2分离株有5处抗原位点和4处受体结合位点发生变异。结论 2018-2019年昭通地区流行的新甲型H1N1和H3N2亚型流感病毒毒株与WHO推荐的当年北半球的疫苗组分匹配,但H3...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料来源
    1.2 方法
        1.2.1 病原学监测
        1.2.2全基因组序列测定
        1.2.3 基因分析与系统进化树构建
        1.2.4 糖基化位点预测
2 结果
    2.1 昭通市流感毒株分离情况
    2.2 流感病毒HA基因特性分析
3 讨论



本文编号：3807856