大理地区单纯感染和Mtb/HIV双重感染Mtb的MLVA法基因分型研究

发布时间：2023-05-07 02:04

　　目的探讨MLVA基因分型法在云南大理地区单纯感染者和合并HIV双重感染者结核分枝杆菌基因分型中的运用,初步研究两种来源不同临床分离株的基因型特征。方法收集大理地区单纯感染肺结核患者和合并HIV双重感染肺结核患者的痰标本,经培养鉴定后运用MLVA法进行基因分型研究。本研究选取15个数目可变串联重复序列(VNTR)特异位点,运用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳技术初步建立检测大理地区结核分枝杆菌DNA指纹图谱方法。运用Quantity One和Bio Numerics(6.6)软件对实验获得的结果进行数字化处理并进行聚类分析。对结核分枝杆菌基因型成簇率、优势菌株分布和人口学等信息运用SPSS19.0统计软件进行统计分析。基因分型的家族结果通过与数据库比对来获得。结果1.通过MLVA法进行基因分型研究,15个位点中分辨能力最高的为MIRU26(HGI=0.839),分辨能力最低的为MIRU4(HGI=0,341)。2.通过运用UPGMA法将122株单纯感染临床分离株和1株H37Rv减毒株分为7个基因群;61株双重感染者临床分离株和1株H37Rv减毒株分为5个基因群。两组中H37Rv减毒...

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
英汉缩略词与英汉对照
中文摘要
英文摘要
前言
材料与方法
    1 实验材料
        1.1 标本来源
        1.2 主要试剂
        1.4 实验耗材
        1.5 实验仪器
        1.6 试剂配制
    2 研究方法
        2.1 结核菌株鉴定
        2.2 结核菌培养
        2.3 结核分枝杆菌DNA提取
        2.4 MLVA基因分型
        2.5 数据分析
结果
    1 标本基本资料
    2 不同VNTR位点检测
        2.1 DNA结果重复性检测
        2.2 VNTR基因位点多态性检测
    3 不同VNTR位点的分辨力
    4 MLVA基因分型
        4.1 计算各个菌株各VNTR重复次数
        4.2 UPGMA法MLVA基因分型
        4.3 MLVA基因分型结果对比
    5 大理地区结核分枝杆菌成簇率分布
    6 优势菌株基因型分布情况
        6.1 北京家族基因型在优势菌株和总菌株中分布情况之间的差异
        6.2 性别在优势与非优势菌株之间的差异
        6.3 年龄在优势基因群和非优势基因群之间的差异
    7 单纯感染菌株和合并HIV双重感染菌株之间的差异
        7.1 性别与菌株之间的差异
        7.2 年龄与菌株之间的差异
    8 61株双重感染者样本UPGMA法计算结果
        8.1 UPGMA树状图结果分析
        8.2 UPGMA法树状图各地区基因型分布特征
        8.3 MLVA基因分型结果对比
        8.4 北京家族基因型在双感优势菌株和全部双感菌株间分布情况的差异
        8.5 性别在优势与非优势菌株之间的差异
        8.6 年龄在双重感染者优势基因群和非优势基因群之间的差异
    9 北京家族基因型在双重感染者和总感染者中分布的差异
讨论
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
课题资助情况
综述
    参考文献
致谢



本文编号：3810029